Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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EXT1Q16394 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXT1Q16394 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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EXT1Q16394 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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EXT1Q16394 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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EXT1Q16394 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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EXT1Q16394 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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EXT1Q16394 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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