Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB2P55268 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms