Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PPARGC1BQ86YN6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms