Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms