Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms