Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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