Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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