Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KRW8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KRW8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
J3KRW8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
J3KRW8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
J3KRW8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
J3KRW8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms