Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIF1AQ16665 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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