Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KRW8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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