Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SETD1BQ9UPS6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SETD1BQ9UPS6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
SETD1BQ9UPS6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SETD1BQ9UPS6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SETD1BQ9UPS6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
SETD1BQ9UPS6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
SETD1BQ9UPS6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SETD1BQ9UPS6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SETD1BQ9UPS6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SETD1BQ9UPS6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
SETD1BQ9UPS6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
SETD1BQ9UPS6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SETD1BQ9UPS6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
SETD1BQ9UPS6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SETD1BQ9UPS6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SETD1BQ9UPS6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SETD1BQ9UPS6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SETD1BQ9UPS6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SETD1BQ9UPS6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
SETD1BQ9UPS6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
SETD1BQ9UPS6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SETD1BQ9UPS6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SETD1BQ9UPS6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms