Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC46.86■■■■■ 5.09
CC2D2AQ9P2K1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC46.86■■■■■ 5.09
CC2D2AQ9P2K1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.85■■■■■ 5.09
CC2D2AQ9P2K1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC46.85■■■■■ 5.09
CC2D2AQ9P2K1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC46.85■■■■■ 5.09
CC2D2AQ9P2K1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
CC2D2AQ9P2K1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC46.84■■■■■ 5.09
CC2D2AQ9P2K1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
CC2D2AQ9P2K1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC46.82■■■■■ 5.09
CC2D2AQ9P2K1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC46.82■■■■■ 5.09
CC2D2AQ9P2K1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.81■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC46.81■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.81■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC46.8■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC46.8■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.8■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.8■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.79■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC46.79■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC46.78■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC46.77■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.77■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC46.76■■■■■ 5.08
CC2D2AQ9P2K1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC46.75■■■■■ 5.07
CC2D2AQ9P2K1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC46.74■■■■■ 5.07
CC2D2AQ9P2K1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
CC2D2AQ9P2K1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
CC2D2AQ9P2K1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
CC2D2AQ9P2K1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
CC2D2AQ9P2K1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
CC2D2AQ9P2K1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
CC2D2AQ9P2K1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
CC2D2AQ9P2K1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
CC2D2AQ9P2K1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC46.72■■■■■ 5.07
CC2D2AQ9P2K1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
CC2D2AQ9P2K1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC46.71■■■■■ 5.07
CC2D2AQ9P2K1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC46.71■■■■■ 5.07
CC2D2AQ9P2K1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
CC2D2AQ9P2K1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
CC2D2AQ9P2K1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC46.69■■■■■ 5.07
CC2D2AQ9P2K1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC46.68■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.66■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.66■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC46.65■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC46.65■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC46.64■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC46.64■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
CC2D2AQ9P2K1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.05
CC2D2AQ9P2K1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC46.62■■■■■ 5.05
CC2D2AQ9P2K1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.61■■■■■ 5.05
CC2D2AQ9P2K1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
CC2D2AQ9P2K1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC46.61■■■■■ 5.05
CC2D2AQ9P2K1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
CC2D2AQ9P2K1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
CC2D2AQ9P2K1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.58■■■■■ 5.05
CC2D2AQ9P2K1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC46.58■■■■■ 5.05
CC2D2AQ9P2K1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
CC2D2AQ9P2K1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.58■■■■■ 5.05
CC2D2AQ9P2K1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
CC2D2AQ9P2K1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC46.56■■■■■ 5.04
CC2D2AQ9P2K1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC46.55■■■■■ 5.04
CC2D2AQ9P2K1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.55■■■■■ 5.04
CC2D2AQ9P2K1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC46.55■■■■■ 5.04
CC2D2AQ9P2K1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
CC2D2AQ9P2K1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC46.53■■■■■ 5.04
CC2D2AQ9P2K1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
CC2D2AQ9P2K1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC46.52■■■■■ 5.04
CC2D2AQ9P2K1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC46.51■■■■■ 5.04
CC2D2AQ9P2K1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
CC2D2AQ9P2K1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC46.5■■■■■ 5.03
CC2D2AQ9P2K1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.5■■■■■ 5.03
CC2D2AQ9P2K1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
CC2D2AQ9P2K1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
CC2D2AQ9P2K1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
CC2D2AQ9P2K1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC46.48■■■■■ 5.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms