Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC59Q9P031 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC59Q9P031 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC59Q9P031 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms