Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTN4Q9NQC3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTN4Q9NQC3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTN4Q9NQC3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RTN4Q9NQC3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms