Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRA1Q9HD15 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRA1Q9HD15 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRA1Q9HD15 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRA1Q9HD15 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms