Protein–RNA interactions for Protein: Q99252

ECM3, Protein ECM3, yeastyeast

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ECM3Q99252 DSC3YOR223W 879 nt7.8□□□□□ -1.16
ECM3Q99252 PMT7YDR307W 1989 nt7.8□□□□□ -1.16
ECM3Q99252 YML079WYML079W 606 nt7.79□□□□□ -1.16
ECM3Q99252 CDC3YLR314C 1563 nt7.79□□□□□ -1.16
ECM3Q99252 BDS1YOL164W 1941 nt7.78□□□□□ -1.16
ECM3Q99252 SKP1YDR328C 585 nt7.78□□□□□ -1.16
ECM3Q99252 OPI1YHL020C 1215 nt7.78□□□□□ -1.16
ECM3Q99252 CAR2YLR438W 1275 nt7.78□□□□□ -1.16
ECM3Q99252 RSC9YML127W 1746 nt7.78□□□□□ -1.16
ECM3Q99252 SNA3YJL151C 402 nt7.77□□□□□ -1.17
ECM3Q99252 PRY2YKR013W 990 nt7.77□□□□□ -1.17
ECM3Q99252 SDH8YBR269C 417 nt7.77□□□□□ -1.17
ECM3Q99252 RPR1RPR1 369 nt7.76□□□□□ -1.17
ECM3Q99252 MAS2YHR024C 1449 nt7.76□□□□□ -1.17
ECM3Q99252 HSV2YGR223C 1347 nt7.76□□□□□ -1.17
ECM3Q99252 SGF73YGL066W 1974 nt7.75□□□□□ -1.17
ECM3Q99252 PFS2YNL317W 1398 nt7.75□□□□□ -1.17
ECM3Q99252 UME1YPL139C 1383 nt7.75□□□□□ -1.17
ECM3Q99252 CKI1YLR133W 1749 nt7.75□□□□□ -1.17
ECM3Q99252 RUP1YOR138C 2016 nt7.74□□□□□ -1.17
ECM3Q99252 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.74□□□□□ -1.17
ECM3Q99252 PIL1YGR086C 1020 nt7.74□□□□□ -1.17
ECM3Q99252 PUP2YGR253C 783 nt7.74□□□□□ -1.17
ECM3Q99252 YPL247CYPL247C 1572 nt7.73□□□□□ -1.17
ECM3Q99252 UFD1YGR048W 1086 nt7.73□□□□□ -1.17
ECM3Q99252 PUS5YLR165C 765 nt7.72□□□□□ -1.17
ECM3Q99252 SNF7YLR025W 723 nt7.71□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 HOG1YLR113W 1308 nt7.71□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 YBL111CYBL111C 2004 nt7.7□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 FHN1YGR131W 525 nt7.7□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 YBL113CYBL113C 2379 nt7.69□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 FIT1YDR534C 1587 nt7.69□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 SLM3YDL033C 1254 nt7.69□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 CYS3YAL012W 1185 nt7.69□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.69□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 YAH1YPL252C 519 nt7.69□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 HNM1YGL077C 1692 nt7.69□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 LPD1YFL018C 1500 nt7.68□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 CCW12YLR110C 402 nt7.68□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 PTH2YBL057C 627 nt7.67□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 YPQ1YOL092W 927 nt7.67□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 YPL067CYPL067C 597 nt7.67□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 YML122CYML122C 381 nt7.66□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 MBF1YOR298C-A 456 nt7.66□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 TPI1YDR050C 747 nt7.65□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 HEM14YER014W 1620 nt7.65□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 YJL213WYJL213W 996 nt7.65□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt7.65□□□□□ -1.18
ECM3Q99252 RTC2YBR147W 891 nt7.64□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 ALR1YOL130W 2580 nt7.64□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 AFG3YER017C 2286 nt7.63□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 KDX1YKL161C 1302 nt7.63□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 TOM71YHR117W 1920 nt7.63□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 TRR2YHR106W 1029 nt7.63□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 CST26YBR042C 1194 nt7.63□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 TCB1YOR086C 3561 nt7.63□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 LAT1YNL071W 1449 nt7.62□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 BNS1YGR230W 414 nt7.62□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 DCR2YLR361C 1737 nt7.61□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 ERG24YNL280C 1317 nt7.61□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 PAM17YKR065C 594 nt7.61□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 REC114YMR133W 1287 nt7.61□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.61□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.61□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.61□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 YOX1YML027W 1158 nt7.6□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 PRS4YBL068W 981 nt7.6□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 COS10YNR075W 1125 nt7.6□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 YDR327WYDR327W 327 nt7.59□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 PDA1YER178W 1263 nt7.59□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 ATG17YLR423C 1254 nt7.59□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 YPL264CYPL264C 1062 nt7.59□□□□□ -1.19
ECM3Q99252 YGL260WYGL260W 231 nt7.58□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 YLR030WYLR030W 792 nt7.58□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 HXT9YJL219W 1704 nt7.58□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 CIT2YCR005C 1383 nt7.58□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 GNA1YFL017C 480 nt7.57□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 RDR1YOR380W 1641 nt7.56□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 DML1YMR211W 1428 nt7.56□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 YHM2YMR241W 945 nt7.56□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 YOR041CYOR041C 432 nt7.56□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 snR30snR30 606 nt7.56□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 NFS1YCL017C 1494 nt7.55□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 PET117YER058W 324 nt7.55□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 NAF1YNL124W 1479 nt7.55□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 YER152CYER152C 1332 nt7.54□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 TOP3YLR234W 1971 nt7.54□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 YPQ2YDR352W 954 nt7.54□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 AIM46YHR199C 933 nt7.54□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 YKL147CYKL147C 618 nt7.54□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.53□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 RMA1YKL132C 1293 nt7.53□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 RTC4YNL254C 1206 nt7.53□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 LIP5YOR196C 1245 nt7.53□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 YPR130CYPR130C 408 nt7.53□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 MAL31YBR298C 1845 nt7.52□□□□□ -1.2
ECM3Q99252 YMR074CYMR074C 438 nt7.52□□□□□ -1.21
ECM3Q99252 MSS51YLR203C 1311 nt7.52□□□□□ -1.21
ECM3Q99252 DMC1YER179W 1005 nt7.51□□□□□ -1.21
ECM3Q99252 URA1YKL216W 945 nt7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.4 ms