RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q99252
ECM3, Protein ECM3, yeast
Predictions only
Length
613 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
ECM3
Q99252
DSC3
YOR223W
879 nt
7.8
□□□□□ -1.16
ECM3
Q99252
PMT7
YDR307W
1989 nt
7.8
□□□□□ -1.16
ECM3
Q99252
YML079W
YML079W
606 nt
7.79
□□□□□ -1.16
ECM3
Q99252
CDC3
YLR314C
1563 nt
7.79
□□□□□ -1.16
ECM3
Q99252
BDS1
YOL164W
1941 nt
7.78
□□□□□ -1.16
ECM3
Q99252
SKP1
YDR328C
585 nt
7.78
□□□□□ -1.16
ECM3
Q99252
OPI1
YHL020C
1215 nt
7.78
□□□□□ -1.16
ECM3
Q99252
CAR2
YLR438W
1275 nt
7.78
□□□□□ -1.16
ECM3
Q99252
RSC9
YML127W
1746 nt
7.78
□□□□□ -1.16
ECM3
Q99252
SNA3
YJL151C
402 nt
7.77
□□□□□ -1.17
ECM3
Q99252
PRY2
YKR013W
990 nt
7.77
□□□□□ -1.17
ECM3
Q99252
SDH8
YBR269C
417 nt
7.77
□□□□□ -1.17
ECM3
Q99252
RPR1
RPR1
369 nt
7.76
□□□□□ -1.17
ECM3
Q99252
MAS2
YHR024C
1449 nt
7.76
□□□□□ -1.17
ECM3
Q99252
HSV2
YGR223C
1347 nt
7.76
□□□□□ -1.17
ECM3
Q99252
SGF73
YGL066W
1974 nt
7.75
□□□□□ -1.17
ECM3
Q99252
PFS2
YNL317W
1398 nt
7.75
□□□□□ -1.17
ECM3
Q99252
UME1
YPL139C
1383 nt
7.75
□□□□□ -1.17
ECM3
Q99252
CKI1
YLR133W
1749 nt
7.75
□□□□□ -1.17
ECM3
Q99252
RUP1
YOR138C
2016 nt
7.74
□□□□□ -1.17
ECM3
Q99252
YEL034C-A
YEL034C-A
603 nt
7.74
□□□□□ -1.17
ECM3
Q99252
PIL1
YGR086C
1020 nt
7.74
□□□□□ -1.17
ECM3
Q99252
PUP2
YGR253C
783 nt
7.74
□□□□□ -1.17
ECM3
Q99252
YPL247C
YPL247C
1572 nt
7.73
□□□□□ -1.17
ECM3
Q99252
UFD1
YGR048W
1086 nt
7.73
□□□□□ -1.17
ECM3
Q99252
PUS5
YLR165C
765 nt
7.72
□□□□□ -1.17
ECM3
Q99252
SNF7
YLR025W
723 nt
7.71
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
HOG1
YLR113W
1308 nt
7.71
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
YBL111C
YBL111C
2004 nt
7.7
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
FHN1
YGR131W
525 nt
7.7
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
YBL113C
YBL113C
2379 nt
7.69
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
FIT1
YDR534C
1587 nt
7.69
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
SLM3
YDL033C
1254 nt
7.69
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
CYS3
YAL012W
1185 nt
7.69
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
YAL019W-A
YAL019W-A
570 nt
7.69
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
YAH1
YPL252C
519 nt
7.69
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
HNM1
YGL077C
1692 nt
7.69
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
LPD1
YFL018C
1500 nt
7.68
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
CCW12
YLR110C
402 nt
7.68
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
PTH2
YBL057C
627 nt
7.67
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
YPQ1
YOL092W
927 nt
7.67
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
YPL067C
YPL067C
597 nt
7.67
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
YML122C
YML122C
381 nt
7.66
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
MBF1
YOR298C-A
456 nt
7.66
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
TPI1
YDR050C
747 nt
7.65
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
HEM14
YER014W
1620 nt
7.65
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
YJL213W
YJL213W
996 nt
7.65
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
YNL067W-A
YNL067W-A
147 nt
7.65
□□□□□ -1.18
ECM3
Q99252
RTC2
YBR147W
891 nt
7.64
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
ALR1
YOL130W
2580 nt
7.64
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
AFG3
YER017C
2286 nt
7.63
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
KDX1
YKL161C
1302 nt
7.63
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
TOM71
YHR117W
1920 nt
7.63
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
TRR2
YHR106W
1029 nt
7.63
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
CST26
YBR042C
1194 nt
7.63
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
TCB1
YOR086C
3561 nt
7.63
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
LAT1
YNL071W
1449 nt
7.62
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
BNS1
YGR230W
414 nt
7.62
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
DCR2
YLR361C
1737 nt
7.61
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
ERG24
YNL280C
1317 nt
7.61
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
PAM17
YKR065C
594 nt
7.61
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
REC114
YMR133W
1287 nt
7.61
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
YRF1-1
YDR545W
5391 nt
7.61
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
YRF1-5
YLR467W
5391 nt
7.61
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
YRF1-8
YOR396W
5391 nt
7.61
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
YOX1
YML027W
1158 nt
7.6
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
PRS4
YBL068W
981 nt
7.6
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
COS10
YNR075W
1125 nt
7.6
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
YDR327W
YDR327W
327 nt
7.59
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
PDA1
YER178W
1263 nt
7.59
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
ATG17
YLR423C
1254 nt
7.59
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
YPL264C
YPL264C
1062 nt
7.59
□□□□□ -1.19
ECM3
Q99252
YGL260W
YGL260W
231 nt
7.58
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
YLR030W
YLR030W
792 nt
7.58
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
HXT9
YJL219W
1704 nt
7.58
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
CIT2
YCR005C
1383 nt
7.58
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
GNA1
YFL017C
480 nt
7.57
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
RDR1
YOR380W
1641 nt
7.56
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
DML1
YMR211W
1428 nt
7.56
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
YHM2
YMR241W
945 nt
7.56
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
YOR041C
YOR041C
432 nt
7.56
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
snR30
snR30
606 nt
7.56
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
NFS1
YCL017C
1494 nt
7.55
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
PET117
YER058W
324 nt
7.55
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
NAF1
YNL124W
1479 nt
7.55
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
YER152C
YER152C
1332 nt
7.54
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
TOP3
YLR234W
1971 nt
7.54
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
YPQ2
YDR352W
954 nt
7.54
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
AIM46
YHR199C
933 nt
7.54
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
YKL147C
YKL147C
618 nt
7.54
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
SUF3
tG(CCC)D
72 nt
7.53
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
RMA1
YKL132C
1293 nt
7.53
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
RTC4
YNL254C
1206 nt
7.53
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
LIP5
YOR196C
1245 nt
7.53
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
YPR130C
YPR130C
408 nt
7.53
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
MAL31
YBR298C
1845 nt
7.52
□□□□□ -1.2
ECM3
Q99252
YMR074C
YMR074C
438 nt
7.52
□□□□□ -1.21
ECM3
Q99252
MSS51
YLR203C
1311 nt
7.52
□□□□□ -1.21
ECM3
Q99252
DMC1
YER179W
1005 nt
7.51
□□□□□ -1.21
ECM3
Q99252
URA1
YKL216W
945 nt
7.51
□□□□□ -1.21
First
Previous
10
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 158.1 ms