Protein–RNA interactions for Protein: Q96M98

PACRG, Parkin coregulated gene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACRGQ96M98 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PACRGQ96M98 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACRGQ96M98 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACRGQ96M98 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACRGQ96M98 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACRGQ96M98 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACRGQ96M98 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACRGQ96M98 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACRGQ96M98 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACRGQ96M98 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACRGQ96M98 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACRGQ96M98 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACRGQ96M98 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACRGQ96M98 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACRGQ96M98 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PACRGQ96M98 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PACRGQ96M98 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PACRGQ96M98 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACRGQ96M98 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PACRGQ96M98 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACRGQ96M98 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms