Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POMGNT2Q8NAT1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POMGNT2Q8NAT1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POMGNT2Q8NAT1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms