Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI97

C11orf88, UPF0722 protein C11orf88, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf88Q6PI97 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf88Q6PI97 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf88Q6PI97 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf88Q6PI97 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C11orf88Q6PI97 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf88Q6PI97 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms