Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RIF1Q5UIP0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIF1Q5UIP0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIF1Q5UIP0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms