Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTF1Q16619 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTF1Q16619 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTF1Q16619 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTF1Q16619 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTF1Q16619 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTF1Q16619 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTF1Q16619 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTF1Q16619 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTF1Q16619 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTF1Q16619 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTF1Q16619 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTF1Q16619 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTF1Q16619 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTF1Q16619 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTF1Q16619 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTF1Q16619 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTF1Q16619 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTF1Q16619 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms