Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCN1Q15293 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCN1Q15293 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCN1Q15293 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCN1Q15293 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCN1Q15293 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCN1Q15293 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCN1Q15293 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCN1Q15293 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RCN1Q15293 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCN1Q15293 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCN1Q15293 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms