Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 YMR166CYMR166C 1107 nt7.73□□□□□ -1.17
SEC39Q12745 EFM1YHL039W 1758 nt7.72□□□□□ -1.17
SEC39Q12745 HEL1YKR017C 1656 nt7.72□□□□□ -1.17
SEC39Q12745 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.71□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.71□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.71□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.71□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.71□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.71□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.71□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 SNF4YGL115W 969 nt7.71□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 AIM2YAL049C 741 nt7.71□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 MFT1YML062C 1179 nt7.71□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 YMR206WYMR206W 942 nt7.71□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 HSM3YBR272C 1443 nt7.7□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 YFR020WYFR020W 699 nt7.7□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 RSM7YJR113C 744 nt7.7□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 EHT1YBR177C 1356 nt7.7□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 SKY1YMR216C 2229 nt7.7□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 EMP65YER140W 1671 nt7.7□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 TAD2YJL035C 753 nt7.69□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 ADA2YDR448W 1305 nt7.69□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 WSC3YOL105C 1671 nt7.69□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 LSP1YPL004C 1026 nt7.68□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 PDC6YGR087C 1692 nt7.67□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 YGR137WYGR137W 375 nt7.67□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 PRE5YMR314W 705 nt7.67□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 SDH8YBR269C 417 nt7.67□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 MSS51YLR203C 1311 nt7.67□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 CLN1YMR199W 1641 nt7.67□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 TCB1YOR086C 3561 nt7.66□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 LOT6YLR011W 576 nt7.66□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 RCF1YML030W 480 nt7.66□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 SMK1YPR054W 1167 nt7.66□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 RSP5YER125W 2430 nt7.66□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 HNM1YGL077C 1692 nt7.65□□□□□ -1.18
SEC39Q12745 TPI1YDR050C 747 nt7.64□□□□□ -1.19
SEC39Q12745 RRT14YIL127C 621 nt7.64□□□□□ -1.19
SEC39Q12745 YLR460CYLR460C 1131 nt7.64□□□□□ -1.19
SEC39Q12745 ELP4YPL101W 1371 nt7.63□□□□□ -1.19
SEC39Q12745 YCR041WYCR041W 333 nt7.63□□□□□ -1.19
SEC39Q12745 NAS6YGR232W 687 nt7.63□□□□□ -1.19
SEC39Q12745 KAE1YKR038C 1161 nt7.63□□□□□ -1.19
SEC39Q12745 YPR084WYPR084W 1371 nt7.62□□□□□ -1.19
SEC39Q12745 YER156CYER156C 1017 nt7.62□□□□□ -1.19
SEC39Q12745 FCY2YER056C 1602 nt7.62□□□□□ -1.19
SEC39Q12745 PET18YCR020C 648 nt7.61□□□□□ -1.19
SEC39Q12745 MGM101YJR144W 810 nt7.61□□□□□ -1.19
SEC39Q12745 SNP1YIL061C 903 nt7.6□□□□□ -1.19
SEC39Q12745 YLR112WYLR112W 420 nt7.59□□□□□ -1.19
SEC39Q12745 FUS3YBL016W 1062 nt7.59□□□□□ -1.19
SEC39Q12745 CHS7YHR142W 951 nt7.58□□□□□ -1.2
SEC39Q12745 VPS65YLR322W 315 nt7.58□□□□□ -1.2
SEC39Q12745 VMA2YBR127C 1554 nt7.58□□□□□ -1.2
SEC39Q12745 CAK1YFL029C 1107 nt7.57□□□□□ -1.2
SEC39Q12745 PET494YNR045W 1470 nt7.56□□□□□ -1.2
SEC39Q12745 UTR5YEL035C 501 nt7.56□□□□□ -1.2
SEC39Q12745 PRY2YKR013W 990 nt7.56□□□□□ -1.2
SEC39Q12745 ADE1YAR015W 921 nt7.56□□□□□ -1.2
SEC39Q12745 MLS1YNL117W 1665 nt7.56□□□□□ -1.2
SEC39Q12745 OCH1YGL038C 1443 nt7.54□□□□□ -1.2
SEC39Q12745 FPR2YDR519W 408 nt7.54□□□□□ -1.2
SEC39Q12745 TDH1YJL052W 999 nt7.54□□□□□ -1.2
SEC39Q12745 HMS2YJR147W 1077 nt7.54□□□□□ -1.2
SEC39Q12745 YPL247CYPL247C 1572 nt7.54□□□□□ -1.2
SEC39Q12745 NUP57YGR119C 1626 nt7.53□□□□□ -1.2
SEC39Q12745 CYB2YML054C 1776 nt7.53□□□□□ -1.2
SEC39Q12745 NUP53YMR153W 1428 nt7.52□□□□□ -1.2
SEC39Q12745 NTG1YAL015C 1200 nt7.52□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 HAM1YJR069C 594 nt7.52□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 SNF7YLR025W 723 nt7.52□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 OLA1YBR025C 1185 nt7.52□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 RTC2YBR147W 891 nt7.52□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 SMC5YOL034W 3282 nt7.52□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 PRP2YNR011C 2631 nt7.51□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 GTT3YEL017W 1014 nt7.51□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 TPK1YJL164C 1194 nt7.51□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 AOS1YPR180W 1044 nt7.51□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 SGE1YPR198W 1632 nt7.51□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 CDC3YLR314C 1563 nt7.5□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 CBK1YNL161W 2271 nt7.5□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 YDR476CYDR476C 675 nt7.5□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 NUP84YDL116W 2181 nt7.5□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 ECM27YJR106W 2178 nt7.49□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 RPS6AYPL090C 711 nt7.49□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 RPS6BYBR181C 711 nt7.49□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 EXG2YDR261C 1689 nt7.48□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 AFG3YER017C 2286 nt7.48□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 CTF8YHR191C 402 nt7.48□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 RNA170RNA170 169 nt7.48□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 NOG2YNR053C 1461 nt7.48□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 YPT31YER031C 672 nt7.47□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 PET10YKR046C 852 nt7.47□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 MET22YOL064C 1074 nt7.47□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 ECM38YLR299W 1983 nt7.47□□□□□ -1.21
SEC39Q12745 BXI1YNL305C 894 nt7.46□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 ARC35YNR035C 1029 nt7.46□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 LIP5YOR196C 1245 nt7.46□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 YHR131CYHR131C 2553 nt7.46□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 GLN3YER040W 2193 nt7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.6 ms