Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 SAY1YGR263C 1275 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 YML101C-AYML101C-A 318 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 CSM3YMR048W 954 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 NRT1YOR071C 1797 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 CLP1YOR250C 1338 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 FIT1YDR534C 1587 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 PRP40YKL012W 1752 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 snR56snR56 88 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 PIB1YDR313C 861 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 WSS1YHR134W 810 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 YGP1YNL160W 1065 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 ALR1YOL130W 2580 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 MST1YKL194C 1389 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 YLH47YPR125W 1365 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 YGL218WYGL218W 651 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 COG5YNL051W 1212 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 INP54YOL065C 1155 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 OMS1YDR316W 1416 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 RRP14YKL082C 1305 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 DLD3YEL071W 1491 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 DUR3YHL016C 2208 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 YFL019CYFL019C 354 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 YFR045WYFR045W 930 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 YMR103CYMR103C 363 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 MIM1YOL026C 342 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 YOL050CYOL050C 321 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 YHR131CYHR131C 2553 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 RPD3YNL330C 1302 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 YDR336WYDR336W 945 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 YSC83YHR017W 1158 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 PEX2YJL210W 816 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 TVP38YKR088C 1014 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 ERV25YML012W 636 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 DPL1YDR294C 1770 nt7.71□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 APM4YOL062C 1476 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YDL114WYDL114W 927 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 RPN9YDR427W 1182 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 PHM8YER037W 966 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 LST7YGR057C 729 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 TIM44YIL022W 1296 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 DTR1YBR180W 1719 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YDR010CYDR010C 333 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 UBX6YJL048C 1191 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 UTH1YKR042W 1098 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YMR262WYMR262W 942 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 MFA2YNL145W 117 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YNL194CYNL194C 906 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 PBP2YBR233W 1242 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 HBS1YKR084C 1836 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YKR023WYKR023W 1593 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 CIT2YCR005C 1383 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 DUS3YLR401C 2007 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 LPD1YFL018C 1500 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YRF1-2YER190W 5046 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 PET18YCR020C 648 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YAP6YDR259C 1152 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 PEF1YGR058W 1008 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 TFB6YOR352W 1032 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 VHS2YIL135C 1311 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 GLE1YDL207W 1617 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YLR271WYLR271W 825 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YML090WYML090W 387 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 VPS75YNL246W 795 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 PRE6YOL038W 765 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 RIM2YBR192W 1134 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 ITR2YOL103W 1830 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 VBA3YCL069W 1377 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 SAL1YNL083W 1485 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 HIP1YGR191W 1812 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 BI2Q0110 1272 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YGL101WYGL101W 648 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 RRT6YGL146C 936 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 ERV29YGR284C 933 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 ERG20YJL167W 1059 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YUH1YJR099W 711 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 SPC42YKL042W 1092 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YKL091CYKL091C 933 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YLL047WYLL047W 384 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YMR144WYMR144W 1029 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 RTC4YNL254C 1206 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YDC1YPL087W 954 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YBR134WYBR134W 402 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 LUC7YDL087C 786 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 HIM1YDR317W 1245 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YFL066CYFL066C 1179 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 GTO1YGR154C 1071 nt7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 87.4 ms