Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 GET4YOR164C 939 nt11.2□□□□□ -0.62
TY1B-BRQ12193 HTZ1YOL012C 405 nt11.19□□□□□ -0.62
TY1B-BRQ12193 FMP40YPL222W 2067 nt11.19□□□□□ -0.62
TY1B-BRQ12193 TPO1YLL028W 1761 nt11.19□□□□□ -0.62
TY1B-BRQ12193 MRP7YNL005C 1116 nt11.18□□□□□ -0.62
TY1B-BRQ12193 COQ3YOL096C 939 nt11.18□□□□□ -0.62
TY1B-BRQ12193 ADE5,7YGL234W 2409 nt11.18□□□□□ -0.62
TY1B-BRQ12193 YPR076WYPR076W 375 nt11.17□□□□□ -0.62
TY1B-BRQ12193 COX15YER141W 1461 nt11.16□□□□□ -0.62
TY1B-BRQ12193 YMR209CYMR209C 1374 nt11.16□□□□□ -0.62
TY1B-BRQ12193 MPE1YKL059C 1326 nt11.16□□□□□ -0.62
TY1B-BRQ12193 ADH5YBR145W 1056 nt11.16□□□□□ -0.62
TY1B-BRQ12193 TUB1YML085C 1344 nt11.16□□□□□ -0.62
TY1B-BRQ12193 DAL80YKR034W 810 nt11.16□□□□□ -0.62
TY1B-BRQ12193 BDS1YOL164W 1941 nt11.15□□□□□ -0.62
TY1B-BRQ12193 GPD2YOL059W 1323 nt11.15□□□□□ -0.62
TY1B-BRQ12193 PAM17YKR065C 594 nt11.15□□□□□ -0.62
TY1B-BRQ12193 SRM1YGL097W 1449 nt11.14□□□□□ -0.63
TY1B-BRQ12193 INM1YHR046C 888 nt11.14□□□□□ -0.63
TY1B-BRQ12193 TGL5YOR081C 2250 nt11.14□□□□□ -0.63
TY1B-BRQ12193 YJL213WYJL213W 996 nt11.13□□□□□ -0.63
TY1B-BRQ12193 RBS1YDL189W 1374 nt11.13□□□□□ -0.63
TY1B-BRQ12193 DMC1YER179W 1005 nt11.13□□□□□ -0.63
TY1B-BRQ12193 YPL102CYPL102C 303 nt11.12□□□□□ -0.63
TY1B-BRQ12193 YHR033WYHR033W 1272 nt11.11□□□□□ -0.63
TY1B-BRQ12193 FPR3YML074C 1236 nt11.11□□□□□ -0.63
TY1B-BRQ12193 FIT2YOR382W 462 nt11.11□□□□□ -0.63
TY1B-BRQ12193 ASR1YPR093C 867 nt11.11□□□□□ -0.63
TY1B-BRQ12193 PRE3YJL001W 648 nt11.1□□□□□ -0.63
TY1B-BRQ12193 YML018CYML018C 1182 nt11.09□□□□□ -0.63
TY1B-BRQ12193 YLR072WYLR072W 2082 nt11.09□□□□□ -0.63
TY1B-BRQ12193 PPH21YDL134C 1110 nt11.08□□□□□ -0.64
TY1B-BRQ12193 ASF1YJL115W 840 nt11.08□□□□□ -0.64
TY1B-BRQ12193 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt11.08□□□□□ -0.64
TY1B-BRQ12193 RTC4YNL254C 1206 nt11.08□□□□□ -0.64
TY1B-BRQ12193 YDR215CYDR215C 414 nt11.07□□□□□ -0.64
TY1B-BRQ12193 YIP4YGL198W 708 nt11.06□□□□□ -0.64
TY1B-BRQ12193 LEA1YPL213W 717 nt11.06□□□□□ -0.64
TY1B-BRQ12193 FET5YFL041W 1869 nt11.06□□□□□ -0.64
TY1B-BRQ12193 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt11.05□□□□□ -0.64
TY1B-BRQ12193 HXT11YOL156W 1704 nt11.05□□□□□ -0.64
TY1B-BRQ12193 MRPS18YNL306W 654 nt11.05□□□□□ -0.64
TY1B-BRQ12193 CDC1YDR182W 1476 nt11.04□□□□□ -0.64
TY1B-BRQ12193 PLB2YMR006C 2121 nt11.04□□□□□ -0.64
TY1B-BRQ12193 CIT2YCR005C 1383 nt11.04□□□□□ -0.64
TY1B-BRQ12193 APE4YHR113W 1473 nt11.03□□□□□ -0.64
TY1B-BRQ12193 YKL102CYKL102C 306 nt11.03□□□□□ -0.64
TY1B-BRQ12193 CDA1YLR307W 906 nt11.02□□□□□ -0.65
TY1B-BRQ12193 YNL092WYNL092W 1203 nt11□□□□□ -0.65
TY1B-BRQ12193 SAL1YNL083W 1485 nt11□□□□□ -0.65
TY1B-BRQ12193 YCR049CYCR049C 447 nt10.99□□□□□ -0.65
TY1B-BRQ12193 TFG2YGR005C 1203 nt10.98□□□□□ -0.65
TY1B-BRQ12193 YKR045CYKR045C 552 nt10.98□□□□□ -0.65
TY1B-BRQ12193 RRP9YPR137W 1722 nt10.98□□□□□ -0.65
TY1B-BRQ12193 YDR187CYDR187C 519 nt10.97□□□□□ -0.65
TY1B-BRQ12193 TAF9YMR236W 474 nt10.96□□□□□ -0.65
TY1B-BRQ12193 YMR295CYMR295C 594 nt10.96□□□□□ -0.65
TY1B-BRQ12193 KTR4YBR199W 1395 nt10.94□□□□□ -0.66
TY1B-BRQ12193 NTG2YOL043C 1143 nt10.93□□□□□ -0.66
TY1B-BRQ12193 YNL140CYNL140C 570 nt10.91□□□□□ -0.66
TY1B-BRQ12193 TOP3YLR234W 1971 nt10.91□□□□□ -0.66
TY1B-BRQ12193 YBR113WYBR113W 483 nt10.9□□□□□ -0.66
TY1B-BRQ12193 ADE16YLR028C 1776 nt10.9□□□□□ -0.66
TY1B-BRQ12193 YPQ2YDR352W 954 nt10.9□□□□□ -0.67
TY1B-BRQ12193 GCG1YER163C 699 nt10.88□□□□□ -0.67
TY1B-BRQ12193 RCF2YNR018W 675 nt10.88□□□□□ -0.67
TY1B-BRQ12193 TSR2YLR435W 618 nt10.88□□□□□ -0.67
TY1B-BRQ12193 LEO1YOR123C 1395 nt10.87□□□□□ -0.67
TY1B-BRQ12193 URA8YJR103W 1737 nt10.87□□□□□ -0.67
TY1B-BRQ12193 PET10YKR046C 852 nt10.87□□□□□ -0.67
TY1B-BRQ12193 YMR122CYMR122C 375 nt10.87□□□□□ -0.67
TY1B-BRQ12193 RNH201YNL072W 924 nt10.87□□□□□ -0.67
TY1B-BRQ12193 RPS28AYOR167C 204 nt10.87□□□□□ -0.67
TY1B-BRQ12193 BRN1YBL097W 2265 nt10.87□□□□□ -0.67
TY1B-BRQ12193 YLL058WYLL058W 1728 nt10.86□□□□□ -0.67
TY1B-BRQ12193 UIP4YPL186C 915 nt10.85□□□□□ -0.67
TY1B-BRQ12193 PSD1YNL169C 1503 nt10.85□□□□□ -0.67
TY1B-BRQ12193 FTH1YBR207W 1398 nt10.84□□□□□ -0.67
TY1B-BRQ12193 SUF3tG(CCC)D 72 nt10.84□□□□□ -0.67
TY1B-BRQ12193 PET117YER058W 324 nt10.84□□□□□ -0.67
TY1B-BRQ12193 CAR2YLR438W 1275 nt10.83□□□□□ -0.68
TY1B-BRQ12193 NUP49YGL172W 1419 nt10.83□□□□□ -0.68
TY1B-BRQ12193 YNR005CYNR005C 405 nt10.82□□□□□ -0.68
TY1B-BRQ12193 TDH2YJR009C 999 nt10.82□□□□□ -0.68
TY1B-BRQ12193 MSC3YLR219W 2187 nt10.81□□□□□ -0.68
TY1B-BRQ12193 BEM1YBR200W 1656 nt10.8□□□□□ -0.68
TY1B-BRQ12193 YHL018WYHL018W 363 nt10.8□□□□□ -0.68
TY1B-BRQ12193 TAE1YBR261C 699 nt10.79□□□□□ -0.68
TY1B-BRQ12193 GPA2YER020W 1350 nt10.78□□□□□ -0.68
TY1B-BRQ12193 YAH1YPL252C 519 nt10.78□□□□□ -0.68
TY1B-BRQ12193 MAM3YOL060C 2121 nt10.78□□□□□ -0.68
TY1B-BRQ12193 EMP65YER140W 1671 nt10.78□□□□□ -0.68
TY1B-BRQ12193 PEX28YHR150W 1740 nt10.77□□□□□ -0.68
TY1B-BRQ12193 RIM8YGL045W 1629 nt10.75□□□□□ -0.69
TY1B-BRQ12193 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt10.75□□□□□ -0.69
TY1B-BRQ12193 RDR1YOR380W 1641 nt10.74□□□□□ -0.69
TY1B-BRQ12193 LYS21YDL131W 1323 nt10.74□□□□□ -0.69
TY1B-BRQ12193 FMO1YHR176W 1299 nt10.74□□□□□ -0.69
TY1B-BRQ12193 AVL9YLR114C 2295 nt10.73□□□□□ -0.69
TY1B-BRQ12193 ZWF1YNL241C 1518 nt10.73□□□□□ -0.69
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