Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 MCM5YLR274W 2328 nt9.13□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 OPI1YHL020C 1215 nt9.13□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 YSC83YHR017W 1158 nt9.13□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 YKL091CYKL091C 933 nt9.13□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 GPN2YOR262W 1044 nt9.13□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 CTF18YMR078C 2226 nt9.12□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 LSM6YDR378C 261 nt9.12□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 WSS1YHR134W 810 nt9.12□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 HIF1YLL022C 1158 nt9.12□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 OST3YOR085W 1053 nt9.12□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 INA1YLR413W 2028 nt9.12□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 YDL119CYDL119C 924 nt9.11□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 PRM5YIL117C 957 nt9.11□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 YML101C-AYML101C-A 318 nt9.11□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 TFB6YOR352W 1032 nt9.11□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 YDC1YPL087W 954 nt9.11□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 RIB2YOL066C 1776 nt9.1□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt9.1□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 PRY1YJL079C 900 nt9.1□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 ERV25YML012W 636 nt9.1□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 YOL150CYOL150C 312 nt9.1□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 YPR177CYPR177C 372 nt9.1□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 YDL114WYDL114W 927 nt9.09□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 ADK2YER170W 678 nt9.09□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 HYM1YKL189W 1200 nt9.09□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 YHL008CYHL008C 1884 nt9.08□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 YGL218WYGL218W 651 nt9.08□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 YGL235WYGL235W 537 nt9.08□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 VPS68YOL129W 555 nt9.08□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 GPI2YPL076W 843 nt9.08□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 MTO1YGL236C 2010 nt9.07□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 SLI1YGR212W 1407 nt9.07□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 LUC7YDL087C 786 nt9.07□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.07□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 SET6YPL165C 1122 nt9.07□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 YPL245WYPL245W 1365 nt9.07□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 CBK1YNL161W 2271 nt9.07□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 HDA1YNL021W 2121 nt9.07□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 DBP1YPL119C 1854 nt9.06□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 YDR336WYDR336W 945 nt9.06□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.06□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.06□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 YUH1YJR099W 711 nt9.06□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 MRPL15YLR312W-A 762 nt9.06□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.06□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.06□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.06□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 RXT2YBR095C 1293 nt9.06□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 RPC82YPR190C 1965 nt9.06□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 VRG4YGL225W 1014 nt9.05□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 INM1YHR046C 888 nt9.05□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 YAL064WYAL064W 285 nt9.05□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 YLL047WYLL047W 384 nt9.05□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 YML090WYML090W 387 nt9.05□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 CBP6YBR120C 489 nt9.05□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 YGR291CYGR291C 222 nt9.04□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 ERG20YJL167W 1059 nt9.04□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 YOL050CYOL050C 321 nt9.04□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 YOL162WYOL162W 648 nt9.04□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt9.04□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 CLD1YGR110W 1338 nt9.04□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 TEP1YNL128W 1305 nt9.04□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 PRP9YDL030W 1593 nt9.03□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 LEU9YOR108W 1815 nt9.03□□□□□ -0.96
TFB4Q12004 HOL1YNR055C 1761 nt9.02□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 ZRT3YKL175W 1512 nt9.02□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 RRI1YDL216C 1323 nt9.02□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 CCT5YJR064W 1689 nt9.01□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 NAP1YKR048C 1254 nt9.01□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 YGP1YNL160W 1065 nt9.01□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 YPL251WYPL251W 303 nt9.01□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 YFL052WYFL052W 1398 nt9□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 YBL086CYBL086C 1401 nt9□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 VMA6YLR447C 1038 nt9□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 YOR062CYOR062C 807 nt9□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 COX11YPL132W 903 nt9□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 DRN1YGR093W 1524 nt9□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 SPO77YLR341W 1434 nt8.99□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 YFL012WYFL012W 447 nt8.99□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 SAY1YGR263C 1275 nt8.99□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 MSO1YNR049C 633 nt8.99□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 HXT1YHR094C 1713 nt8.99□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 ALR1YOL130W 2580 nt8.99□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 MST1YKL194C 1389 nt8.99□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 HXK1YFR053C 1458 nt8.98□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 EAF5YEL018W 840 nt8.98□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 YFH7YFR007W 1062 nt8.98□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 PEF1YGR058W 1008 nt8.98□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 DID2YKR035W-A 615 nt8.98□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt8.98□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 YML094C-AYML094C-A 402 nt8.98□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 HRT1YOL133W 366 nt8.98□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 RAS1YOR101W 930 nt8.98□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 SCP1YOR367W 603 nt8.98□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 SRL4YPL033C 846 nt8.98□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 RRP14YKL082C 1305 nt8.98□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 ILV3YJR016C 1758 nt8.97□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 CSM1YCR086W 573 nt8.97□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 DUO1YGL061C 744 nt8.97□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 KSS1YGR040W 1107 nt8.97□□□□□ -0.97
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