Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 SEC24YIL109C 2781 nt7.09□□□□□ -1.27
YHC1Q05900 CTF3YLR381W 2202 nt7.09□□□□□ -1.27
YHC1Q05900 FLC2YAL053W 2352 nt7.09□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 AFG2YLR397C 2343 nt7.09□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 BAP3YDR046C 1815 nt7.08□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 YMR253CYMR253C 1245 nt7.08□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 RMD8YFR048W 1989 nt7.08□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 AFG3YER017C 2286 nt7.07□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 MSS51YLR203C 1311 nt7.07□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 YPT10YBR264C 600 nt7.07□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 PRB1YEL060C 1908 nt7.07□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 YKL147CYKL147C 618 nt7.06□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 RSC4YKR008W 1878 nt7.06□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 YDR327WYDR327W 327 nt7.05□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 RPL12BYDR418W 498 nt7.05□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 CRN1YLR429W 1956 nt7.04□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.04□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.04□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.04□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.04□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.04□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.04□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.04□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 DSC3YOR223W 879 nt7.04□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 PAU21YOR394W 495 nt7.04□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 PAU22YPL282C 495 nt7.04□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 ERG24YNL280C 1317 nt7.03□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.03□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 STS1YIR011C 960 nt7.03□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 PRY2YKR013W 990 nt7.03□□□□□ -1.28
YHC1Q05900 YER137CYER137C 447 nt7.02□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 NCA3YJL116C 1014 nt7.02□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 YJR142WYJR142W 1029 nt7.02□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 LIP5YOR196C 1245 nt7.02□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 CCR4YAL021C 2514 nt7.02□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 TOD6YBL054W 1578 nt7.02□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 POB3YML069W 1659 nt7.02□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 CAN1YEL063C 1773 nt7.02□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 ENB1YOL158C 1821 nt7.01□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 TOS1YBR162C 1368 nt7.01□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 SKP1YDR328C 585 nt7.01□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 YIL108WYIL108W 2091 nt7□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 AQR1YNL065W 1761 nt7□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 OSM1YJR051W 1506 nt7□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 HRB1YNL004W 1365 nt6.99□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 HRA1HRA1 564 nt6.99□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 FCY2YER056C 1602 nt6.98□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 YDR476CYDR476C 675 nt6.98□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 NMA2YGR010W 1188 nt6.98□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 RDR1YOR380W 1641 nt6.98□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 FUS3YBL016W 1062 nt6.97□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 ATO2YNR002C 849 nt6.97□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 BNA3YJL060W 1335 nt6.97□□□□□ -1.29
YHC1Q05900 NUP57YGR119C 1626 nt6.96□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 EXG2YDR261C 1689 nt6.96□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 MAM3YOL060C 2121 nt6.95□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 LOT6YLR011W 576 nt6.95□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 PIL1YGR086C 1020 nt6.94□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 CCW12YLR110C 402 nt6.94□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 YOR343CYOR343C 327 nt6.94□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 MSI1YBR195C 1269 nt6.94□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 CDC7YDL017W 1524 nt6.93□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 YMR074CYMR074C 438 nt6.93□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 NME1NME1 340 nt6.93□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 MCM5YLR274W 2328 nt6.93□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 YJL213WYJL213W 996 nt6.92□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 MAS2YHR024C 1449 nt6.92□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 PGI1YBR196C 1665 nt6.91□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 NUP84YDL116W 2181 nt6.91□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 ADE2YOR128C 1716 nt6.91□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 YGL081WYGL081W 963 nt6.91□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 Q0010Q0010 387 nt6.91□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 PET494YNR045W 1470 nt6.91□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 CDC3YLR314C 1563 nt6.91□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.9□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt6.9□□□□□ -1.3
YHC1Q05900 DOC1YGL240W 753 nt6.89□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 ADH6YMR318C 1083 nt6.89□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 MAS1YLR163C 1389 nt6.89□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 YNL040WYNL040W 1371 nt6.88□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 ERG27YLR100W 1044 nt6.88□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 RFS1YBR052C 633 nt6.88□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 HXT13YEL069C 1695 nt6.87□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 MHP1YJL042W 4197 nt6.87□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 PHO85YPL031C 918 nt6.87□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 MSB3YNL293W 1902 nt6.86□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 YCR041WYCR041W 333 nt6.86□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 SNF4YGL115W 969 nt6.86□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 BUD20YLR074C 501 nt6.86□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 SUN4YNL066W 1263 nt6.86□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 PET117YER058W 324 nt6.85□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 YOR012WYOR012W 414 nt6.85□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 CIT2YCR005C 1383 nt6.84□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 DMC1YER179W 1005 nt6.84□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 YLR112WYLR112W 420 nt6.84□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 YLR358CYLR358C 564 nt6.84□□□□□ -1.31
YHC1Q05900 SNU66YOR308C 1764 nt6.83□□□□□ -1.32
YHC1Q05900 SDH8YBR269C 417 nt6.83□□□□□ -1.32
YHC1Q05900 CDC13YDL220C 2775 nt6.82□□□□□ -1.32
YHC1Q05900 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.6 ms