Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE1BQ01064 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE1BQ01064 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE1BQ01064 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms