Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPAP49450 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPAP49450 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPAP49450 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPAP49450 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPAP49450 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPAP49450 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPAP49450 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPAP49450 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPAP49450 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPAP49450 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CENPAP49450 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPAP49450 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPAP49450 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPAP49450 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPAP49450 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPAP49450 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPAP49450 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPAP49450 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPAP49450 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPAP49450 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPAP49450 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPAP49450 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPAP49450 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPAP49450 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPAP49450 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPAP49450 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPAP49450 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPAP49450 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPAP49450 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPAP49450 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPAP49450 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPAP49450 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPAP49450 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPAP49450 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPAP49450 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPAP49450 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPAP49450 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPAP49450 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPAP49450 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPAP49450 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPAP49450 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPAP49450 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPAP49450 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPAP49450 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPAP49450 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPAP49450 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPAP49450 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPAP49450 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPAP49450 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPAP49450 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPAP49450 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPAP49450 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPAP49450 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPAP49450 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPAP49450 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPAP49450 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPAP49450 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPAP49450 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPAP49450 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPAP49450 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPAP49450 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPAP49450 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPAP49450 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPAP49450 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPAP49450 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPAP49450 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPAP49450 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPAP49450 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPAP49450 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPAP49450 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPAP49450 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPAP49450 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPAP49450 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPAP49450 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPAP49450 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPAP49450 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPAP49450 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPAP49450 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPAP49450 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPAP49450 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPAP49450 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPAP49450 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPAP49450 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPAP49450 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPAP49450 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPAP49450 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPAP49450 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPAP49450 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPAP49450 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPAP49450 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPAP49450 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPAP49450 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPAP49450 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPAP49450 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPAP49450 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPAP49450 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPAP49450 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPAP49450 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPAP49450 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms