Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
UTRNP46939 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
UTRNP46939 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
UTRNP46939 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
UTRNP46939 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
UTRNP46939 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
UTRNP46939 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
UTRNP46939 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
UTRNP46939 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
UTRNP46939 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
UTRNP46939 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
UTRNP46939 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
UTRNP46939 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
UTRNP46939 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
UTRNP46939 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
UTRNP46939 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
UTRNP46939 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
UTRNP46939 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
UTRNP46939 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
UTRNP46939 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
UTRNP46939 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
UTRNP46939 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
UTRNP46939 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
UTRNP46939 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
UTRNP46939 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
UTRNP46939 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
UTRNP46939 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
UTRNP46939 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
UTRNP46939 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
UTRNP46939 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
UTRNP46939 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
UTRNP46939 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
UTRNP46939 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
UTRNP46939 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
UTRNP46939 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
UTRNP46939 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
UTRNP46939 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
UTRNP46939 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
UTRNP46939 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
UTRNP46939 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
UTRNP46939 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
UTRNP46939 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
UTRNP46939 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
UTRNP46939 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
UTRNP46939 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
UTRNP46939 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
UTRNP46939 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
UTRNP46939 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
UTRNP46939 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
UTRNP46939 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
UTRNP46939 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
UTRNP46939 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
UTRNP46939 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
UTRNP46939 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
UTRNP46939 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
UTRNP46939 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
UTRNP46939 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
UTRNP46939 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
UTRNP46939 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
UTRNP46939 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
UTRNP46939 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
UTRNP46939 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
UTRNP46939 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
UTRNP46939 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
UTRNP46939 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
UTRNP46939 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
UTRNP46939 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
UTRNP46939 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
UTRNP46939 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
UTRNP46939 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
UTRNP46939 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
UTRNP46939 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
UTRNP46939 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
UTRNP46939 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
UTRNP46939 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
UTRNP46939 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
UTRNP46939 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
UTRNP46939 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
UTRNP46939 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
UTRNP46939 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
UTRNP46939 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
UTRNP46939 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
UTRNP46939 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
UTRNP46939 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
UTRNP46939 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
UTRNP46939 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
UTRNP46939 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
UTRNP46939 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
UTRNP46939 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
UTRNP46939 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
UTRNP46939 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
UTRNP46939 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
UTRNP46939 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
UTRNP46939 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
UTRNP46939 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
UTRNP46939 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
UTRNP46939 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
UTRNP46939 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
UTRNP46939 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
UTRNP46939 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms