Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 RMD8YFR048W 1989 nt7.97□□□□□ -1.13
VFA1P40080 PRY2YKR013W 990 nt7.96□□□□□ -1.14
VFA1P40080 PAU21YOR394W 495 nt7.96□□□□□ -1.14
VFA1P40080 PAU22YPL282C 495 nt7.96□□□□□ -1.14
VFA1P40080 ERR3YMR323W 1314 nt7.96□□□□□ -1.14
VFA1P40080 ERR1YOR393W 1314 nt7.96□□□□□ -1.14
VFA1P40080 ERR2YPL281C 1314 nt7.96□□□□□ -1.14
VFA1P40080 MSS51YLR203C 1311 nt7.95□□□□□ -1.14
VFA1P40080 BAP3YDR046C 1815 nt7.94□□□□□ -1.14
VFA1P40080 YDR327WYDR327W 327 nt7.94□□□□□ -1.14
VFA1P40080 AFG3YER017C 2286 nt7.94□□□□□ -1.14
VFA1P40080 OSM1YJR051W 1506 nt7.93□□□□□ -1.14
VFA1P40080 TOP3YLR234W 1971 nt7.93□□□□□ -1.14
VFA1P40080 YGL260WYGL260W 231 nt7.93□□□□□ -1.14
VFA1P40080 STS1YIR011C 960 nt7.93□□□□□ -1.14
VFA1P40080 DSC3YOR223W 879 nt7.93□□□□□ -1.14
VFA1P40080 PRB1YEL060C 1908 nt7.92□□□□□ -1.14
VFA1P40080 SKP1YDR328C 585 nt7.92□□□□□ -1.14
VFA1P40080 YJR142WYJR142W 1029 nt7.92□□□□□ -1.14
VFA1P40080 LIP5YOR196C 1245 nt7.92□□□□□ -1.14
VFA1P40080 YPL041CYPL041C 624 nt7.92□□□□□ -1.14
VFA1P40080 FLC2YAL053W 2352 nt7.92□□□□□ -1.14
VFA1P40080 YER137CYER137C 447 nt7.91□□□□□ -1.14
VFA1P40080 YKL147CYKL147C 618 nt7.91□□□□□ -1.14
VFA1P40080 ERG24YNL280C 1317 nt7.91□□□□□ -1.14
VFA1P40080 CRN1YLR429W 1956 nt7.91□□□□□ -1.14
VFA1P40080 SEC24YIL109C 2781 nt7.91□□□□□ -1.14
VFA1P40080 RPL12BYDR418W 498 nt7.9□□□□□ -1.14
VFA1P40080 HRA1HRA1 564 nt7.9□□□□□ -1.14
VFA1P40080 YDR476CYDR476C 675 nt7.88□□□□□ -1.15
VFA1P40080 CAN1YEL063C 1773 nt7.88□□□□□ -1.15
VFA1P40080 GID7YCL039W 2238 nt7.87□□□□□ -1.15
VFA1P40080 POB3YML069W 1659 nt7.87□□□□□ -1.15
VFA1P40080 TOD6YBL054W 1578 nt7.87□□□□□ -1.15
VFA1P40080 GTB1YDR221W 2109 nt7.86□□□□□ -1.15
VFA1P40080 NMA2YGR010W 1188 nt7.86□□□□□ -1.15
VFA1P40080 HEM14YER014W 1620 nt7.85□□□□□ -1.15
VFA1P40080 FCY2YER056C 1602 nt7.85□□□□□ -1.15
VFA1P40080 HRB1YNL004W 1365 nt7.85□□□□□ -1.15
VFA1P40080 FUS3YBL016W 1062 nt7.85□□□□□ -1.15
VFA1P40080 RDR1YOR380W 1641 nt7.85□□□□□ -1.15
VFA1P40080 EXG2YDR261C 1689 nt7.84□□□□□ -1.15
VFA1P40080 ENB1YOL158C 1821 nt7.83□□□□□ -1.16
VFA1P40080 NUP57YGR119C 1626 nt7.83□□□□□ -1.16
VFA1P40080 YOR343CYOR343C 327 nt7.83□□□□□ -1.16
VFA1P40080 AQR1YNL065W 1761 nt7.83□□□□□ -1.16
VFA1P40080 PET494YNR045W 1470 nt7.82□□□□□ -1.16
VFA1P40080 CCW12YLR110C 402 nt7.82□□□□□ -1.16
VFA1P40080 BNA3YJL060W 1335 nt7.81□□□□□ -1.16
VFA1P40080 YGL081WYGL081W 963 nt7.81□□□□□ -1.16
VFA1P40080 CDC7YDL017W 1524 nt7.81□□□□□ -1.16
VFA1P40080 CDC3YLR314C 1563 nt7.8□□□□□ -1.16
VFA1P40080 KAE1YKR038C 1161 nt7.8□□□□□ -1.16
VFA1P40080 MSI1YBR195C 1269 nt7.8□□□□□ -1.16
VFA1P40080 COG1YGL223C 1254 nt7.79□□□□□ -1.16
VFA1P40080 PIL1YGR086C 1020 nt7.79□□□□□ -1.16
VFA1P40080 DOC1YGL240W 753 nt7.78□□□□□ -1.16
VFA1P40080 LOT6YLR011W 576 nt7.78□□□□□ -1.16
VFA1P40080 BUD20YLR074C 501 nt7.78□□□□□ -1.16
VFA1P40080 PGI1YBR196C 1665 nt7.78□□□□□ -1.16
VFA1P40080 YLR358CYLR358C 564 nt7.77□□□□□ -1.17
VFA1P40080 YMR074CYMR074C 438 nt7.77□□□□□ -1.17
VFA1P40080 YJL213WYJL213W 996 nt7.76□□□□□ -1.17
VFA1P40080 ADH6YMR318C 1083 nt7.76□□□□□ -1.17
VFA1P40080 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.75□□□□□ -1.17
VFA1P40080 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt7.75□□□□□ -1.17
VFA1P40080 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.75□□□□□ -1.17
VFA1P40080 GGC1YDL198C 903 nt7.74□□□□□ -1.17
VFA1P40080 SNF4YGL115W 969 nt7.74□□□□□ -1.17
VFA1P40080 PET117YER058W 324 nt7.73□□□□□ -1.17
VFA1P40080 ERG27YLR100W 1044 nt7.73□□□□□ -1.17
VFA1P40080 RFS1YBR052C 633 nt7.72□□□□□ -1.17
VFA1P40080 DMC1YER179W 1005 nt7.71□□□□□ -1.18
VFA1P40080 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.71□□□□□ -1.18
VFA1P40080 YCR041WYCR041W 333 nt7.7□□□□□ -1.18
VFA1P40080 YOR012WYOR012W 414 nt7.7□□□□□ -1.18
VFA1P40080 SDH8YBR269C 417 nt7.7□□□□□ -1.18
VFA1P40080 ALR1YOL130W 2580 nt7.7□□□□□ -1.18
VFA1P40080 CIT2YCR005C 1383 nt7.7□□□□□ -1.18
VFA1P40080 MAS2YHR024C 1449 nt7.69□□□□□ -1.18
VFA1P40080 PAM17YKR065C 594 nt7.69□□□□□ -1.18
VFA1P40080 YML122CYML122C 381 nt7.69□□□□□ -1.18
VFA1P40080 SUN4YNL066W 1263 nt7.69□□□□□ -1.18
VFA1P40080 PHO85YPL031C 918 nt7.69□□□□□ -1.18
VFA1P40080 ATO2YNR002C 849 nt7.68□□□□□ -1.18
VFA1P40080 RPL43AYPR043W 279 nt7.68□□□□□ -1.18
VFA1P40080 FRT1YOR324C 1809 nt7.68□□□□□ -1.18
VFA1P40080 GNP1YDR508C 1992 nt7.68□□□□□ -1.18
VFA1P40080 AIM2YAL049C 741 nt7.67□□□□□ -1.18
VFA1P40080 YLR112WYLR112W 420 nt7.67□□□□□ -1.18
VFA1P40080 ATP23YNR020C 813 nt7.67□□□□□ -1.18
VFA1P40080 YTH1YPR107C 627 nt7.67□□□□□ -1.18
VFA1P40080 NUP84YDL116W 2181 nt7.66□□□□□ -1.18
VFA1P40080 FAF1YIL019W 1041 nt7.66□□□□□ -1.18
VFA1P40080 DPM1YPR183W 804 nt7.66□□□□□ -1.18
VFA1P40080 CTA1YDR256C 1548 nt7.65□□□□□ -1.18
VFA1P40080 PMA2YPL036W 2844 nt7.65□□□□□ -1.18
VFA1P40080 UME1YPL139C 1383 nt7.64□□□□□ -1.19
VFA1P40080 THR1YHR025W 1074 nt7.64□□□□□ -1.19
VFA1P40080 IRC5YFR038W 2562 nt7.63□□□□□ -1.19
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