Protein–RNA interactions for Protein: P31483

TIA1, Nucleolysin TIA-1 isoform p40, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIA1P31483 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.034e-11■■■■■ 36.2
TIA1P31483 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.214e-11■■■■■ 36.2
TIA1P31483 AZIN1-207ENST00000520402 660 ntTSL 412.3□□□□□ -0.444e-11■■■■■ 36.2
TIA1P31483 CYTH2-213ENST00000620214 2020 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.514e-11■■■■■ 36.2
TIA1P31483 CYTH2-210ENST00000493260 4652 ntTSL 511.7□□□□□ -0.544e-11■■■■■ 36.2
TIA1P31483 AZIN1-203ENST00000517581 576 ntTSL 48.57□□□□□ -1.044e-11■■■■■ 36.2
TIA1P31483 AZIN1-206ENST00000518940 574 ntTSL 37.83□□□□□ -1.164e-11■■■■■ 36.2
TIA1P31483 AZIN1-204ENST00000518353 773 ntTSL 56.26□□□□□ -1.414e-11■■■■■ 36.2
TIA1P31483 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.211e-10■■■■■ 36.2
TIA1P31483 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.281e-10■■■■■ 36.2
TIA1P31483 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.281e-10■■■■■ 36.2
TIA1P31483 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.344e-7■■■■■ 36.2
TIA1P31483 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 36.2
TIA1P31483 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 36.2
TIA1P31483 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.877e-18■■■■■ 36.1
TIA1P31483 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.767e-18■■■■■ 36.1
TIA1P31483 OGT-204ENST00000455587 632 ntTSL 37.33□□□□□ -1.246e-11■■■■■ 36.1
TIA1P31483 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.296e-11■■■■■ 36.1
TIA1P31483 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.426e-11■■■■■ 36.1
TIA1P31483 OGT-210ENST00000488174 7243 ntTSL 55.88□□□□□ -1.476e-11■■■■■ 36.1
TIA1P31483 OGT-211ENST00000498566 601 ntTSL 33.8□□□□□ -1.86e-11■■■■■ 36.1
TIA1P31483 FAM102A-201ENST00000300434 3148 ntTSL 1 (best)13.34□□□□□ -0.279e-13■■■■■ 36.1
TIA1P31483 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.499e-13■■■■■ 36.1
TIA1P31483 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.59e-13■■■■■ 36.1
TIA1P31483 FAM102A-204ENST00000465821 4316 ntTSL 211.39□□□□□ -0.599e-13■■■■■ 36.1
TIA1P31483 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-14■■■■■ 36
TIA1P31483 SNRPD3-204ENST00000439775 640 ntTSL 314.89□□□□□ -0.032e-14■■■■■ 36
TIA1P31483 SNRPD3-203ENST00000404603 715 ntTSL 57.92□□□□□ -1.142e-14■■■■■ 36
TIA1P31483 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.32e-14■■■■■ 36
TIA1P31483 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.051e-8■■■■■ 36
TIA1P31483 MAP4-212ENST00000468075 487 ntTSL 514.29□□□□□ -0.121e-8■■■■■ 36
TIA1P31483 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.351e-8■■■■■ 36
TIA1P31483 MAP4-207ENST00000426837 8920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 36
TIA1P31483 MAP4-206ENST00000423088 899 ntTSL 37.85□□□□□ -1.151e-8■■■■■ 36
TIA1P31483 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.171e-8■■■■■ 36
TIA1P31483 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.712e-9■■■■■ 35.9
TIA1P31483 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.016e-8■■■■■ 35.9
TIA1P31483 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.587e-8■■■■■ 35.9
TIA1P31483 WDR59-222ENST00000570070 565 ntTSL 49.87□□□□□ -0.831e-8■■■■■ 35.9
TIA1P31483 WDR59-217ENST00000569229 901 ntTSL 59.63□□□□□ -0.871e-8■■■■■ 35.9
TIA1P31483 WDR59-205ENST00000562371 562 ntTSL 29.15□□□□□ -0.941e-8■■■■■ 35.9
TIA1P31483 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 35.8
TIA1P31483 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 35.8
TIA1P31483 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 35.8
TIA1P31483 SPATS2L-208ENST00000409718 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.491e-7■■■■■ 35.8
TIA1P31483 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 35.8
TIA1P31483 SPATS2L-206ENST00000409385 2320 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 35.8
TIA1P31483 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 35.8
TIA1P31483 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.121e-7■■■■■ 35.8
TIA1P31483 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.886e-7■■■■■ 35.8
TIA1P31483 ATF7IP2-209ENST00000562396 1681 nt21.47■■□□□ 1.037e-12■■■■■ 35.7
TIA1P31483 ATF7IP2-216ENST00000569900 559 ntTSL 415.21■□□□□ 0.037e-12■■■■■ 35.7
TIA1P31483 ATF7IP2-207ENST00000561932 538 ntTSL 413.84□□□□□ -0.197e-12■■■■■ 35.7
TIA1P31483 ATF7IP2-210ENST00000562527 625 ntTSL 39.7□□□□□ -0.867e-12■■■■■ 35.7
TIA1P31483 ATF7IP2-217ENST00000569939 564 ntTSL 47.17□□□□□ -1.267e-12■■■■■ 35.7
TIA1P31483 ATF7IP2-211ENST00000564797 450 ntTSL 35.15□□□□□ -1.597e-12■■■■■ 35.7
TIA1P31483 ATF7IP2-208ENST00000562102 558 ntTSL 44.69□□□□□ -1.667e-12■■■■■ 35.7
TIA1P31483 ATF7IP2-218ENST00000570163 559 ntTSL 21.78□□□□□ -2.127e-12■■■■■ 35.7
TIA1P31483 ATF7IP2-214ENST00000566316 576 ntTSL 21.07□□□□□ -2.247e-12■■■■■ 35.7
TIA1P31483 AC011476.3-201ENST00000593060 786 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.21e-16■■■■■ 35.7
TIA1P31483 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.481e-16■■■■■ 35.7
TIA1P31483 SNRPB-203ENST00000474384 985 ntTSL 517.04■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 35.7
TIA1P31483 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 35.7
TIA1P31483 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 35.7
TIA1P31483 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.114e-8■■■■■ 35.7
TIA1P31483 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.299e-12■■■■■ 35.7
TIA1P31483 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.289e-12■■■■■ 35.7
TIA1P31483 RPL27A-212ENST00000534599 651 ntTSL 512.21□□□□□ -0.459e-12■■■■■ 35.7
TIA1P31483 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.599e-12■■■■■ 35.7
TIA1P31483 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.389e-12■■■■■ 35.7
TIA1P31483 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.49e-12■■■■■ 35.7
TIA1P31483 MARCH6-213ENST00000514961 703 ntTSL 55.95□□□□□ -1.461e-12■■■■■ 35.6
TIA1P31483 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 35.5
TIA1P31483 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 35.5
TIA1P31483 DHRSX-207ENST00000478825 679 ntTSL 220.91■□□□□ 0.941e-9■■■■■ 35.5
TIA1P31483 DHRSX-203ENST00000430536 490 ntTSL 218.99■□□□□ 0.631e-9■■■■■ 35.5
TIA1P31483 DHRSX-202ENST00000412516 744 ntTSL 218.59■□□□□ 0.571e-9■■■■■ 35.5
TIA1P31483 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.531e-9■■■■■ 35.5
TIA1P31483 DHRSX-205ENST00000444280 797 ntTSL 215.91■□□□□ 0.141e-9■■■■■ 35.5
TIA1P31483 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.121e-9■■■■■ 35.5
TIA1P31483 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.171e-9■■■■■ 35.5
TIA1P31483 DHRSX-204ENST00000441131 539 ntTSL 26.97□□□□□ -1.291e-9■■■■■ 35.5
TIA1P31483 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.191e-12■■■■■ 35.5
TIA1P31483 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.841e-12■■■■■ 35.5
TIA1P31483 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.461e-12■■■■■ 35.5
TIA1P31483 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.51e-12■■■■■ 35.5
TIA1P31483 SEPT10-201ENST00000356688 3091 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.531e-12■■■■■ 35.5
TIA1P31483 SEPT10-203ENST00000397714 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.61e-12■■■■■ 35.5
TIA1P31483 AC068631.2-201ENST00000418776 501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.731e-12■■■■■ 35.5
TIA1P31483 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.251e-12■■■■■ 35.5
TIA1P31483 DNAJB11-204ENST00000495390 4079 ntTSL 26.85□□□□□ -1.311e-12■■■■■ 35.5
TIA1P31483 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.341e-12■■■■■ 35.5
TIA1P31483 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.29e-8■■■■■ 35.4
TIA1P31483 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.259e-8■■■■■ 35.4
TIA1P31483 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.289e-8■■■■■ 35.4
TIA1P31483 HNRNPH1-218ENST00000510678 1996 ntTSL 513.2□□□□□ -0.39e-8■■■■■ 35.4
TIA1P31483 HNRNPH1-223ENST00000514332 2444 ntTSL 213.03□□□□□ -0.329e-8■■■■■ 35.4
TIA1P31483 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.389e-8■■■■■ 35.4
TIA1P31483 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.479e-8■■■■■ 35.4
TIA1P31483 SRSF11-209ENST00000463877 617 ntTSL 226.31■■□□□ 1.84e-7■■■■■ 35.3
Retrieved 100 of 17,249 protein–RNA pairs in 355.2 ms