Protein–RNA interactions for Protein: P25364

HCM1, Forkhead transcription factor HCM1, yeastyeast

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCM1P25364 YGL081WYGL081W 963 nt7.45□□□□□ -1.22
HCM1P25364 NMA2YGR010W 1188 nt7.45□□□□□ -1.22
HCM1P25364 STS1YIR011C 960 nt7.45□□□□□ -1.22
HCM1P25364 YNL190WYNL190W 615 nt7.45□□□□□ -1.22
HCM1P25364 CYS4YGR155W 1524 nt7.44□□□□□ -1.22
HCM1P25364 OPI7YDR360W 435 nt7.44□□□□□ -1.22
HCM1P25364 REC114YMR133W 1287 nt7.44□□□□□ -1.22
HCM1P25364 ADH6YMR318C 1083 nt7.44□□□□□ -1.22
HCM1P25364 ERV2YPR037C 591 nt7.44□□□□□ -1.22
HCM1P25364 LAS17YOR181W 1902 nt7.44□□□□□ -1.22
HCM1P25364 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.43□□□□□ -1.22
HCM1P25364 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.43□□□□□ -1.22
HCM1P25364 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.43□□□□□ -1.22
HCM1P25364 HSV2YGR223C 1347 nt7.43□□□□□ -1.22
HCM1P25364 AAC3YBR085W 924 nt7.42□□□□□ -1.22
HCM1P25364 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.41□□□□□ -1.22
HCM1P25364 ARO3YDR035W 1113 nt7.41□□□□□ -1.22
HCM1P25364 AIM20YIL158W 615 nt7.41□□□□□ -1.22
HCM1P25364 YJL107CYJL107C 1164 nt7.41□□□□□ -1.22
HCM1P25364 YMC2YBR104W 990 nt7.41□□□□□ -1.22
HCM1P25364 ECM10YEL030W 1935 nt7.4□□□□□ -1.22
HCM1P25364 MCM5YLR274W 2328 nt7.4□□□□□ -1.22
HCM1P25364 PUS5YLR165C 765 nt7.4□□□□□ -1.22
HCM1P25364 MDH2YOL126C 1134 nt7.4□□□□□ -1.22
HCM1P25364 LEA1YPL213W 717 nt7.4□□□□□ -1.22
HCM1P25364 ARG7YMR062C 1326 nt7.4□□□□□ -1.22
HCM1P25364 CDC3YLR314C 1563 nt7.4□□□□□ -1.22
HCM1P25364 HXT8YJL214W 1710 nt7.39□□□□□ -1.23
HCM1P25364 YJL009WYJL009W 327 nt7.39□□□□□ -1.23
HCM1P25364 LDB7YBL006C 543 nt7.39□□□□□ -1.23
HCM1P25364 PMT7YDR307W 1989 nt7.39□□□□□ -1.23
HCM1P25364 ABP1YCR088W 1779 nt7.38□□□□□ -1.23
HCM1P25364 TES1YJR019C 1050 nt7.38□□□□□ -1.23
HCM1P25364 AIM34YMR003W 597 nt7.38□□□□□ -1.23
HCM1P25364 ATG17YLR423C 1254 nt7.37□□□□□ -1.23
HCM1P25364 ERG10YPL028W 1197 nt7.37□□□□□ -1.23
HCM1P25364 FCY22YER060W-A 1593 nt7.37□□□□□ -1.23
HCM1P25364 VAR1Q0140 1197 nt7.36□□□□□ -1.23
HCM1P25364 SML1YML058W 315 nt7.36□□□□□ -1.23
HCM1P25364 AI3Q0060 1248 nt7.35□□□□□ -1.23
HCM1P25364 HRB1YNL004W 1365 nt7.34□□□□□ -1.23
HCM1P25364 ITR1YDR497C 1755 nt7.34□□□□□ -1.23
HCM1P25364 YBR056WYBR056W 1506 nt7.34□□□□□ -1.23
HCM1P25364 FAF1YIL019W 1041 nt7.34□□□□□ -1.23
HCM1P25364 IMD1YAR073W 1212 nt7.34□□□□□ -1.23
HCM1P25364 ADE2YOR128C 1716 nt7.34□□□□□ -1.23
HCM1P25364 YIL177CYIL177C 5277 nt7.33□□□□□ -1.24
HCM1P25364 snR86snR86 1004 nt7.33□□□□□ -1.24
HCM1P25364 MRS4YKR052C 915 nt7.33□□□□□ -1.24
HCM1P25364 RCF1YML030W 480 nt7.33□□□□□ -1.24
HCM1P25364 AST1YBL069W 1290 nt7.33□□□□□ -1.24
HCM1P25364 RSM23YGL129C 1353 nt7.33□□□□□ -1.24
HCM1P25364 EHT1YBR177C 1356 nt7.32□□□□□ -1.24
HCM1P25364 SNU66YOR308C 1764 nt7.31□□□□□ -1.24
HCM1P25364 YEL074WYEL074W 339 nt7.31□□□□□ -1.24
HCM1P25364 FHN1YGR131W 525 nt7.31□□□□□ -1.24
HCM1P25364 LSM12YHR121W 564 nt7.31□□□□□ -1.24
HCM1P25364 PRC1YMR297W 1599 nt7.31□□□□□ -1.24
HCM1P25364 SCS22YBL091C-A 528 nt7.31□□□□□ -1.24
HCM1P25364 MAM3YOL060C 2121 nt7.31□□□□□ -1.24
HCM1P25364 FRT1YOR324C 1809 nt7.31□□□□□ -1.24
HCM1P25364 YDR387CYDR387C 1668 nt7.31□□□□□ -1.24
HCM1P25364 RRP43YCR035C 1185 nt7.3□□□□□ -1.24
HCM1P25364 MOD5YOR274W 1287 nt7.3□□□□□ -1.24
HCM1P25364 OSM1YJR051W 1506 nt7.3□□□□□ -1.24
HCM1P25364 PMA2YPL036W 2844 nt7.29□□□□□ -1.24
HCM1P25364 FYV1YDR024W 486 nt7.29□□□□□ -1.24
HCM1P25364 HOS2YGL194C 1359 nt7.29□□□□□ -1.24
HCM1P25364 NDE1YMR145C 1683 nt7.28□□□□□ -1.24
HCM1P25364 DML1YMR211W 1428 nt7.28□□□□□ -1.24
HCM1P25364 TOP3YLR234W 1971 nt7.28□□□□□ -1.24
HCM1P25364 LRO1YNR008W 1986 nt7.28□□□□□ -1.24
HCM1P25364 PSA1YDL055C 1086 nt7.28□□□□□ -1.24
HCM1P25364 GLY1YEL046C 1164 nt7.28□□□□□ -1.24
HCM1P25364 PIC2YER053C 903 nt7.28□□□□□ -1.24
HCM1P25364 HIS3YOR202W 663 nt7.28□□□□□ -1.24
HCM1P25364 YKL153WYKL153W 510 nt7.27□□□□□ -1.25
HCM1P25364 PRY2YKR013W 990 nt7.27□□□□□ -1.25
HCM1P25364 SWP1YMR149W 861 nt7.27□□□□□ -1.25
HCM1P25364 KDX1YKL161C 1302 nt7.27□□□□□ -1.25
HCM1P25364 GGC1YDL198C 903 nt7.26□□□□□ -1.25
HCM1P25364 YGL118CYGL118C 438 nt7.26□□□□□ -1.25
HCM1P25364 PIL1YGR086C 1020 nt7.26□□□□□ -1.25
HCM1P25364 MDH1YKL085W 1005 nt7.26□□□□□ -1.25
HCM1P25364 YLR162WYLR162W 357 nt7.26□□□□□ -1.25
HCM1P25364 snR30snR30 606 nt7.26□□□□□ -1.25
HCM1P25364 BEM1YBR200W 1656 nt7.25□□□□□ -1.25
HCM1P25364 DCR2YLR361C 1737 nt7.25□□□□□ -1.25
HCM1P25364 CHA1YCL064C 1083 nt7.25□□□□□ -1.25
HCM1P25364 GPD1YDL022W 1176 nt7.25□□□□□ -1.25
HCM1P25364 YGR137WYGR137W 375 nt7.25□□□□□ -1.25
HCM1P25364 YML122CYML122C 381 nt7.25□□□□□ -1.25
HCM1P25364 STE3YKL178C 1413 nt7.25□□□□□ -1.25
HCM1P25364 NFS1YCL017C 1494 nt7.24□□□□□ -1.25
HCM1P25364 YHP1YDR451C 1062 nt7.24□□□□□ -1.25
HCM1P25364 CPR2YHR057C 618 nt7.24□□□□□ -1.25
HCM1P25364 LIA1YJR070C 978 nt7.24□□□□□ -1.25
HCM1P25364 HOC1YJR075W 1191 nt7.24□□□□□ -1.25
HCM1P25364 YPL168WYPL168W 1293 nt7.24□□□□□ -1.25
HCM1P25364 INP54YOL065C 1155 nt7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 101.7 ms