Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCMT1P22061 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCMT1P22061 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms