Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGAVP06756 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGAVP06756 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAVP06756 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAVP06756 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAVP06756 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAVP06756 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAVP06756 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAVP06756 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAVP06756 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGAVP06756 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAVP06756 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAVP06756 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAVP06756 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAVP06756 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAVP06756 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAVP06756 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAVP06756 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAVP06756 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAVP06756 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms