Protein–RNA interactions for Protein: O75592

MYCBP2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, humanhuman

Predictions only

Length 4,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBP2O75592 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYCBP2O75592 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms