Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 SEC11C-201ENST00000299714 727 ntTSL 513.27□□□□□ -0.292e-9■■■■■ 62.7
DDX3XO00571 SEC11C-208ENST00000593132 586 ntTSL 313.21□□□□□ -0.296e-45■■■■■ 62.7
DDX3XO00571 TSPAN3-206ENST00000559373 393 ntTSL 320.65■□□□□ 0.92e-13■■■■■ 62.7
DDX3XO00571 ZNF664-201ENST00000337815 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.571e-10■■■■■ 62.6
DDX3XO00571 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.661e-17■■■■■ 62.4
DDX3XO00571 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.482e-24■■■■■ 62.4
DDX3XO00571 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.094e-21■■■■■ 62.2
DDX3XO00571 DNPH1-204ENST00000509253 834 ntTSL 330.94■■■□□ 2.545e-63■■■■■ 61.9
DDX3XO00571 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.225e-63■■■■■ 61.9
DDX3XO00571 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.75e-63■■■■■ 61.9
DDX3XO00571 NDUFB1-205ENST00000556555 568 ntTSL 322.79■■□□□ 1.242e-27■■■■■ 61.6
DDX3XO00571 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.22e-10■■■■■ 61.3
DDX3XO00571 PARN-204ENST00000538472 808 ntTSL 220.31■□□□□ 0.842e-10■■■■■ 61.3
DDX3XO00571 PARN-209ENST00000563641 1029 ntTSL 518.53■□□□□ 0.562e-10■■■■■ 61.3
DDX3XO00571 PARN-214ENST00000566021 598 ntTSL 318.47■□□□□ 0.552e-10■■■■■ 61.3
DDX3XO00571 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.292e-10■■■■■ 61.3
DDX3XO00571 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.222e-10■■■■■ 61.3
DDX3XO00571 PARN-207ENST00000562896 577 ntTSL 410.81□□□□□ -0.682e-10■■■■■ 61.3
DDX3XO00571 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.132e-10■■■■■ 61.3
DDX3XO00571 YES1-204ENST00000581960 487 ntTSL 324.51■■□□□ 1.515e-18■■■■■ 61.2
DDX3XO00571 YES1-202ENST00000577611 568 ntTSL 419.96■□□□□ 0.795e-18■■■■■ 61.2
DDX3XO00571 YES1-205ENST00000584307 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.855e-18■■■■■ 61.2
DDX3XO00571 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.871e-48■■■■■ 61.2
DDX3XO00571 CTSH-202ENST00000525807 1122 ntTSL 519.36■□□□□ 0.691e-48■■■■■ 61.2
DDX3XO00571 CTSH-216ENST00000534268 622 ntTSL 519.16■□□□□ 0.661e-48■■■■■ 61.2
DDX3XO00571 CTSH-214ENST00000534038 593 ntTSL 419.16■□□□□ 0.661e-48■■■■■ 61.2
DDX3XO00571 CTSH-213ENST00000533777 2101 ntTSL 1 (best)19.09■□□□□ 0.651e-48■■■■■ 61.2
DDX3XO00571 CTSH-206ENST00000528436 268 ntTSL 318.47■□□□□ 0.551e-48■■■■■ 61.2
DDX3XO00571 CTSH-211ENST00000530010 556 ntTSL 218.34■□□□□ 0.531e-48■■■■■ 61.2
DDX3XO00571 CTSH-210ENST00000529861 857 ntTSL 318.32■□□□□ 0.521e-48■■■■■ 61.2
DDX3XO00571 CTSH-207ENST00000528741 719 ntTSL 512.28□□□□□ -0.441e-48■■■■■ 61.2
DDX3XO00571 CTSH-212ENST00000530929 479 ntTSL 35.14□□□□□ -1.591e-48■■■■■ 61.2
DDX3XO00571 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.762e-13■■■■■ 61.2
DDX3XO00571 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.582e-13■■■■■ 61.2
DDX3XO00571 NTAN1-208ENST00000568320 667 ntTSL 219.91■□□□□ 0.783e-13■■■■■ 61.1
DDX3XO00571 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.783e-13■■■■■ 61.1
DDX3XO00571 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.783e-13■■■■■ 61.1
DDX3XO00571 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.743e-13■■■■■ 61.1
DDX3XO00571 NTAN1-206ENST00000567030 454 ntTSL 213.34□□□□□ -0.273e-13■■■■■ 61.1
DDX3XO00571 NTAN1-203ENST00000565187 1043 ntTSL 211.03□□□□□ -0.643e-13■■■■■ 61.1
DDX3XO00571 NTAN1-204ENST00000566419 738 ntTSL 37.58□□□□□ -1.23e-13■■■■■ 61.1
DDX3XO00571 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.912e-11■■■■■ 61.1
DDX3XO00571 HSPA14-202ENST00000437161 1689 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.292e-11■■■■■ 61.1
DDX3XO00571 HSPA14-201ENST00000378372 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.572e-11■■■■■ 61.1
DDX3XO00571 HSPA14-205ENST00000493178 569 ntTSL 511.26□□□□□ -0.612e-11■■■■■ 61.1
DDX3XO00571 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.742e-12■■■■■ 61
DDX3XO00571 TOR1AIP2-205ENST00000495650 888 ntTSL 210.23□□□□□ -0.774e-13■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.224e-13■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.334e-13■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.384e-13■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 TRAF4-211ENST00000478021 718 ntTSL 323.4■■□□□ 1.343e-27■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 TRAF4-203ENST00000394925 702 ntTSL 220.91■□□□□ 0.942e-23■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 TRAF4-212ENST00000498540 748 ntTSL 314.49□□□□□ -0.092e-23■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.972e-21■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.622e-21■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.552e-21■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.552e-21■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 ISCU-207ENST00000539580 1169 ntTSL 1 (best)18.48■□□□□ 0.552e-21■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 ISCU-213ENST00000552072 738 ntTSL 217.98■□□□□ 0.472e-21■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.472e-21■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.462e-21■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 ISCU-204ENST00000535405 819 ntTSL 217.76■□□□□ 0.432e-21■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 ISCU-211ENST00000545932 3685 ntTSL 214.27□□□□□ -0.132e-21■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 DHRS4-AS1-203ENST00000554036 509 ntTSL 311.42□□□□□ -0.581e-13■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.73e-9■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.483e-9■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.453e-9■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.43e-9■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.273e-9■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 TEX264-213ENST00000489026 800 ntTSL 215.63■□□□□ 0.093e-9■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 TEX264-206ENST00000419358 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.29■□□□□ 0.043e-9■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 TEX264-207ENST00000425781 583 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.07■□□□□ 03e-9■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.033e-9■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 TEX264-203ENST00000412249 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.49□□□□□ -0.253e-9■■■■■ 60.9
DDX3XO00571 ZSCAN29-203ENST00000561661 643 ntTSL 326.83■■□□□ 1.891e-10■■■■■ 60.8
DDX3XO00571 RCSD1-201ENST00000361496 822 ntTSL 320.33■□□□□ 0.857e-7■■■■■ 60.2
DDX3XO00571 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.277e-7■■■■■ 60.2
DDX3XO00571 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.187e-7■■■■■ 60.2
DDX3XO00571 TMEM248-205ENST00000433271 1610 ntTSL 1 (best)28.16■■■□□ 2.15e-13■■■■■ 60.2
DDX3XO00571 TMEM248-207ENST00000607045 690 ntTSL 321.94■■□□□ 1.15e-13■■■■■ 60.2
DDX3XO00571 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.135e-13■■■■■ 60.2
DDX3XO00571 APEX2-202ENST00000471758 728 ntTSL 29.6□□□□□ -0.874e-14■■■■■ 59.9
DDX3XO00571 APEX2-201ENST00000374987 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.934e-14■■■■■ 59.9
DDX3XO00571 ATXN7L3-207ENST00000589805 622 ntTSL 319.83■□□□□ 0.771e-9■■■■■ 59.9
DDX3XO00571 ATXN7L3-208ENST00000590169 593 ntTSL 48.09□□□□□ -1.111e-9■■■■■ 59.9
DDX3XO00571 DRAM1-205ENST00000549365 611 ntTSL 38.51□□□□□ -1.053e-11■■■■■ 59.8
DDX3XO00571 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.031e-9■■■■■ 59.7
DDX3XO00571 MALSU1-205ENST00000481564 625 ntTSL 220.36■□□□□ 0.853e-12■■■■■ 59.6
DDX3XO00571 MALSU1-201ENST00000287543 572 ntTSL 219.34■□□□□ 0.693e-12■■■■■ 59.6
DDX3XO00571 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.183e-12■■■■■ 59.6
DDX3XO00571 MALSU1-204ENST00000479974 497 ntTSL 24.42□□□□□ -1.73e-12■■■■■ 59.6
DDX3XO00571 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.72e-7■■■■■ 59.6
DDX3XO00571 PIP4K2B-202ENST00000617499 547 ntTSL 417.27■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 59.6
DDX3XO00571 PIP4K2B-203ENST00000617781 927 ntTSL 213.15□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 59.6
DDX3XO00571 SERPINE2-204ENST00000423446 581 ntTSL 414.12□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 59.5
DDX3XO00571 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.242e-30■■■■■ 59.4
DDX3XO00571 PCSK1N-202ENST00000611033 392 ntTSL 312.62□□□□□ -0.391e-16■■■■■ 59.4
DDX3XO00571 SFT2D2-203ENST00000471981 666 ntTSL 524.37■■□□□ 1.494e-12■■■■■ 59.4
DDX3XO00571 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.224e-12■■■■■ 59.4
DDX3XO00571 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.394e-12■■■■■ 59.4
Retrieved 100 of 47,714 protein–RNA pairs in 3670.8 ms