RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629407.2

PCBP1-AS1-345, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 767 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 NISCHQ9Y2I1 1504 aa18.69■□□□□ 0.58
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa16.64■□□□□ 0.25
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 ABCC9O60706 1549 aa16.31■□□□□ 0.2
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.22■□□□□ 0.19
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa15.7■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 NACADO15069 1562 aa15.68■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 DCAF8L2P0C7V8 631 aa15.63■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 MYO15BQ96JP2 1530 aa15.59■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa15.49■□□□□ 0.07
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.29■□□□□ 0.04
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.24■□□□□ 0.03
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.21■□□□□ 0.03
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 SCRIBQ14160 1630 aa15.14■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa15.1■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.05■□□□□ -0
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa14.77□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.69□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 SMARCA4P51532 1647 aa14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 NCAPD3P42695 1498 aa14.48□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa14.45□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 SMARCA2P51531 1590 aa14.44□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 MROH2BQ7Z745 1585 aa14.39□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 PEG3Q9GZU2 1588 aa14.39□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 HMGXB3Q12766 1538 aa14.38□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 WIZO95785 1651 aa14.21□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 NESP48681 1621 aa14.1□□□□□ -0.15
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.09□□□□□ -0.15
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 ERCC6Q03468 1493 aa14.08□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.05□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.02□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 CUX2O14529 1486 aa13.99□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 CFTRP13569 1480 aa13.94□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 CCDC88BA6NC98 1476 aa13.93□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13.91□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 FANCD2Q9BXW9 1451 aa13.87□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 CEP164Q9UPV0 1460 aa13.86□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 MRC2Q9UBG0 1479 aa13.85□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 WDR62O43379 1518 aa13.81□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 PRDM2Q13029 1718 aa13.79□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 ABCC8Q09428 1581 aa13.67□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.64□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 TOPBP1Q92547 1522 aa13.64□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13.61□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 IFT140Q96RY7 1462 aa13.58□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 CUX1P39880 1505 aa13.5□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 SOGA1O94964 1423 aa13.47□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 FGD5Q6ZNL6 1462 aa13.46□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa13.44□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 WDR97A6NE52 1622 aa13.42□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP13.42□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 OSCARQ8IYS5 282 aa13.41□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP13.4□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 FOXD1Q16676 465 aa13.39□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 TOP2BQ02880 1626 aa13.38□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa13.37□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa13.35□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 SYNJ1O43426 1573 aa13.34□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 PLPPR3Q6T4P5 718 aa13.33□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 GRIN2BQ13224 1484 aa13.32□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 GAPVD1Q14C86 1478 aa13.31□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa13.29□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa13.28□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 FBLN2P98095 1184 aa13.27□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 CHD1O14646 1710 aa13.26□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 PBRM1Q86U86 1689 aa13.25□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 SYNJ2O15056 1496 aa13.24□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 ERICH3Q5RHP9 1530 aa13.19□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 FHAD1B1AJZ9 1412 aa13.17□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 ADAMTS12P58397 1594 aa13.16□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa13.16□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa13.16□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa13.16□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 ARHGEF11O15085 1522 aa13.15□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 CLASP1Q7Z460 1538 aa13.15□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 KIF27Q86VH2 1401 aa13.14□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 GRIN2AQ12879 1464 aa13.14□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 TRIM41Q8WV44 630 aa13.12□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 IGF1RP08069 1367 aa13.1□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 NUP160Q12769 1436 aa13.09□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 CEP170Q5SW79 1584 aa13.06□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-345ENST00000629407 CYB5RLQ6IPT4 315 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms