RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628667.2

PCBP1-AS1-332, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 745 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.06■□□□□ 0.16
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 NISCHQ9Y2I1 1504 aa14.9□□□□□ -0.02
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa13.31□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 FOXD1Q16676 465 aa13.24□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 PLPPR3Q6T4P5 718 aa12.89□□□□□ -0.35
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 ABCC9O60706 1549 aa12.65□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 MYO15BQ96JP2 1530 aa12.57□□□□□ -0.4
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.57□□□□□ -0.4
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 ADRA2BP18089 450 aa12.52□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa12.51□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 NACADO15069 1562 aa12.48□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa12.42□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 MSH5O43196 834 aa12.24□□□□□ -0.45
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa12.14□□□□□ -0.47
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 DCAF8L2P0C7V8 631 aa12.07□□□□□ -0.48
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 UNC13AQ9UPW8 1703 aa12.03□□□□□ -0.48
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 BICRAQ9NZM4 1560 aa11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 SCRIBQ14160 1630 aa11.91□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP11.74□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 POTEDQ86YR6 584 aa11.66□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.54□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.54□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 SMARCA4P51532 1647 aa11.52□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 SMARCA2P51531 1590 aa11.51□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 NCAPD3P42695 1498 aa11.49□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 HMGXB3Q12766 1538 aa11.48□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 CECR2Q9BXF3 1484 aa11.45□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 DNAJC5BQ9UF47 199 aa11.45□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa11.44□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 MROH2BQ7Z745 1585 aa11.39□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.36□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.3□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 WIZO95785 1651 aa11.23□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa11.18□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 CADPSQ9ULU8 1353 aa11.11□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 CFTRP13569 1480 aa11.09□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.07□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 PDS5BQ9NTI5 1447 aa11.07□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 CCDC88BA6NC98 1476 aa11.04□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 PRDM2Q13029 1718 aa11.04□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 CUX2O14529 1486 aa10.98□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 ERCC6Q03468 1493 aa10.97□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 NESP48681 1621 aa10.96□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 CEP164Q9UPV0 1460 aa10.94□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.93□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 ABCC8Q09428 1581 aa10.93□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.92□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 WDR62O43379 1518 aa10.91□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa10.9□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 NPM3O75607 178 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 KCNA4P22459 653 aa10.84□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.82□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 DCAF8L1A6NGE4 600 aa10.8□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 WDR97A6NE52 1622 aa10.8□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 TOPBP1Q92547 1522 aa10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 IFT140Q96RY7 1462 aa10.75□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 TOP2BQ02880 1626 aa10.71□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa10.71□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP10.7□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 CUX1P39880 1505 aa10.69□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.65□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.65□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 SOGA1O94964 1423 aa10.62□□□□□ -0.71
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 SYNJ1O43426 1573 aa10.6□□□□□ -0.71
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.58□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 GRIN2BQ13224 1484 aa10.55□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 ERICH3Q5RHP9 1530 aa10.55□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 GAPVD1Q14C86 1478 aa10.53□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.53□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 RNF39Q9H2S5 420 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 KIF27Q86VH2 1401 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 SYNJ2O15056 1496 aa10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 PBRM1Q86U86 1689 aa10.48□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 EEA1Q15075 1411 aa10.47□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-332ENST00000628667 FHAD1B1AJZ9 1412 aa10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms