RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625625.2

PCBP1-AS1-279, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 1,025 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PCBP1-AS1-279ENST00000625625 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa11.57□□□□□ -0.56
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PCBP1-AS1-279ENST00000625625 GAPVD1Q14C86 1478 aa10.96□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-279ENST00000625625 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa10.96□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-279ENST00000625625 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-279ENST00000625625 PRDM2Q13029 1718 aa10.94□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-279ENST00000625625 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-279ENST00000625625 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.93□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-279ENST00000625625 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-279ENST00000625625 SYNJ1O43426 1573 aa10.93□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-279ENST00000625625 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.91□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-279ENST00000625625 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.9□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-279ENST00000625625 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-279ENST00000625625 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-279ENST00000625625 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-279ENST00000625625 ERCC6L2Q5T890 1561 aa10.86□□□□□ -0.67
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PCBP1-AS1-279ENST00000625625 ABCC8Q09428 1581 aa10.86□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-279ENST00000625625 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
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PCBP1-AS1-279ENST00000625625 SYNJ2O15056 1496 aa10.8□□□□□ -0.68
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