RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620043.4

TTLL9-211, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 9, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTLL9, Length 3,034 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9-211ENST00000620043 NISCHQ9Y2I1 1504 aa19.42■□□□□ 0.7
TTLL9-211ENST00000620043 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa17.63■□□□□ 0.41
TTLL9-211ENST00000620043 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.64■□□□□ 0.25
TTLL9-211ENST00000620043 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.49■□□□□ 0.23
TTLL9-211ENST00000620043 NACADO15069 1562 aa16.42■□□□□ 0.22
TTLL9-211ENST00000620043 ABCC9O60706 1549 aa16.36■□□□□ 0.21
TTLL9-211ENST00000620043 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.31■□□□□ 0.2
TTLL9-211ENST00000620043 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
TTLL9-211ENST00000620043 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.12■□□□□ 0.17
TTLL9-211ENST00000620043 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.89■□□□□ 0.14
TTLL9-211ENST00000620043 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.74■□□□□ 0.11
TTLL9-211ENST00000620043 SCRIBQ14160 1630 aa15.43■□□□□ 0.06
TTLL9-211ENST00000620043 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
TTLL9-211ENST00000620043 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.22■□□□□ 0.03
TTLL9-211ENST00000620043 DCAF8L2P0C7V8 631 aa15.19■□□□□ 0.02
TTLL9-211ENST00000620043 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.12■□□□□ 0.01
TTLL9-211ENST00000620043 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
TTLL9-211ENST00000620043 HMGXB3Q12766 1538 aa15.09■□□□□ 0.01
TTLL9-211ENST00000620043 SMARCA2P51531 1590 aa15.08■□□□□ 0
TTLL9-211ENST00000620043 SMARCA4P51532 1647 aa15.07■□□□□ 0
TTLL9-211ENST00000620043 NCAPD3P42695 1498 aa15.05■□□□□ -0
TTLL9-211ENST00000620043 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.03■□□□□ -0
TTLL9-211ENST00000620043 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.9□□□□□ -0.02
TTLL9-211ENST00000620043 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa14.9□□□□□ -0.02
TTLL9-211ENST00000620043 DNAJC5BQ9UF47 199 aa14.83□□□□□ -0.04
TTLL9-211ENST00000620043 MROH2BQ7Z745 1585 aa14.76□□□□□ -0.05
TTLL9-211ENST00000620043 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TTLL9-211ENST00000620043 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TTLL9-211ENST00000620043 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.7□□□□□ -0.06
TTLL9-211ENST00000620043 PRDM2Q13029 1718 aa14.66□□□□□ -0.06
TTLL9-211ENST00000620043 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TTLL9-211ENST00000620043 WIZO95785 1651 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL9-211ENST00000620043 SLC24A1O60721 1099 aa14.5□□□□□ -0.09
TTLL9-211ENST00000620043 CUX2O14529 1486 aa14.49□□□□□ -0.09
TTLL9-211ENST00000620043 CFTRP13569 1480 aa14.46□□□□□ -0.09
TTLL9-211ENST00000620043 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.42□□□□□ -0.1
TTLL9-211ENST00000620043 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
TTLL9-211ENST00000620043 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.41□□□□□ -0.1
TTLL9-211ENST00000620043 WDR62O43379 1518 aa14.36□□□□□ -0.11
TTLL9-211ENST00000620043 WDR97A6NE52 1622 aa14.34□□□□□ -0.11
TTLL9-211ENST00000620043 ABCC8Q09428 1581 aa14.33□□□□□ -0.11
TTLL9-211ENST00000620043 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.31□□□□□ -0.12
TTLL9-211ENST00000620043 CCDC88BA6NC98 1476 aa14.3□□□□□ -0.12
TTLL9-211ENST00000620043 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.28□□□□□ -0.12
TTLL9-211ENST00000620043 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.23□□□□□ -0.13
TTLL9-211ENST00000620043 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.2□□□□□ -0.14
TTLL9-211ENST00000620043 NESP48681 1621 aa14.19□□□□□ -0.14
TTLL9-211ENST00000620043 ERCC6Q03468 1493 aa14.19□□□□□ -0.14
TTLL9-211ENST00000620043 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.17□□□□□ -0.14
TTLL9-211ENST00000620043 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.08□□□□□ -0.16
TTLL9-211ENST00000620043 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
TTLL9-211ENST00000620043 IFT140Q96RY7 1462 aa14.06□□□□□ -0.16
TTLL9-211ENST00000620043 TOPBP1Q92547 1522 aa14.04□□□□□ -0.16
TTLL9-211ENST00000620043 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
TTLL9-211ENST00000620043 TOP2BQ02880 1626 aa13.98□□□□□ -0.17
TTLL9-211ENST00000620043 CUX1P39880 1505 aa13.91□□□□□ -0.18
TTLL9-211ENST00000620043 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa13.89□□□□□ -0.19
TTLL9-211ENST00000620043 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa13.88□□□□□ -0.19
TTLL9-211ENST00000620043 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
TTLL9-211ENST00000620043 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
TTLL9-211ENST00000620043 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
TTLL9-211ENST00000620043 ERICH3Q5RHP9 1530 aa13.8□□□□□ -0.2
TTLL9-211ENST00000620043 FGD5Q6ZNL6 1462 aa13.8□□□□□ -0.2
TTLL9-211ENST00000620043 PBRM1Q86U86 1689 aa13.8□□□□□ -0.2
TTLL9-211ENST00000620043 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP13.78□□□□□ -0.2
TTLL9-211ENST00000620043 HRCP23327 699 aa13.77□□□□□ -0.2
TTLL9-211ENST00000620043 SYNJ1O43426 1573 aa13.76□□□□□ -0.21
TTLL9-211ENST00000620043 GRIN2BQ13224 1484 aa13.74□□□□□ -0.21
TTLL9-211ENST00000620043 SOGA1O94964 1423 aa13.74□□□□□ -0.21
TTLL9-211ENST00000620043 CUL7Q14999 1698 aa13.72□□□□□ -0.21
TTLL9-211ENST00000620043 ADAMTS12P58397 1594 aa13.68□□□□□ -0.22
TTLL9-211ENST00000620043 CLASP1Q7Z460 1538 aa13.67□□□□□ -0.22
TTLL9-211ENST00000620043 SYNJ2O15056 1496 aa13.66□□□□□ -0.22
TTLL9-211ENST00000620043 GAPVD1Q14C86 1478 aa13.65□□□□□ -0.22
TTLL9-211ENST00000620043 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
TTLL9-211ENST00000620043 CHD1O14646 1710 aa13.64□□□□□ -0.23
TTLL9-211ENST00000620043 SHROOM2Q13796 1616 aa13.62□□□□□ -0.23
TTLL9-211ENST00000620043 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.61□□□□□ -0.23
TTLL9-211ENST00000620043 FHAD1B1AJZ9 1412 aa13.6□□□□□ -0.23
TTLL9-211ENST00000620043 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
TTLL9-211ENST00000620043 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa13.59□□□□□ -0.23
TTLL9-211ENST00000620043 NUP160Q12769 1436 aa13.58□□□□□ -0.24
TTLL9-211ENST00000620043 EEA1Q15075 1411 aa13.58□□□□□ -0.24
TTLL9-211ENST00000620043 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
TTLL9-211ENST00000620043 EHMT2Q96KQ7 1210 aa13.57□□□□□ -0.24
TTLL9-211ENST00000620043 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
TTLL9-211ENST00000620043 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa13.55□□□□□ -0.24
TTLL9-211ENST00000620043 KIF27Q86VH2 1401 aa13.55□□□□□ -0.24
TTLL9-211ENST00000620043 GRIN2AQ12879 1464 aa13.52□□□□□ -0.25
TTLL9-211ENST00000620043 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.25
TTLL9-211ENST00000620043 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa13.47□□□□□ -0.25
TTLL9-211ENST00000620043 OSCARQ8IYS5 282 aa13.47□□□□□ -0.25
TTLL9-211ENST00000620043 PCGF6Q9BYE7 350 aa13.47□□□□□ -0.25
TTLL9-211ENST00000620043 CEP170Q5SW79 1584 aa13.44□□□□□ -0.26
TTLL9-211ENST00000620043 IGF1RP08069 1367 aa13.43□□□□□ -0.26
TTLL9-211ENST00000620043 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa13.42□□□□□ -0.26
TTLL9-211ENST00000620043 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa13.42□□□□□ -0.26
TTLL9-211ENST00000620043 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa13.42□□□□□ -0.26
TTLL9-211ENST00000620043 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
TTLL9-211ENST00000620043 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms