RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610429.1

MYO15B-231, Transcript of myosin XVB, human

TSL 4

Gene MYO15B, Length 469 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYO15B-231	ENST00000610429	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		37.41	■■■■□ 3.58
MYO15B-231	ENST00000610429	ABCC9	O60706	1549 aa		35.2	■■■■□ 3.23
MYO15B-231	ENST00000610429	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		34.19	■■■■□ 3.06
MYO15B-231	ENST00000610429	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.01	■■■■□ 3.04
MYO15B-231	ENST00000610429	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		32.98	■■■□□ 2.87
MYO15B-231	ENST00000610429	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.62	■■■□□ 2.81
MYO15B-231	ENST00000610429	NACAD	O15069	1562 aa		32.49	■■■□□ 2.79
MYO15B-231	ENST00000610429	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.27	■■■□□ 2.76
MYO15B-231	ENST00000610429	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.15	■■■□□ 2.74
MYO15B-231	ENST00000610429	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.1	■■■□□ 2.73
MYO15B-231	ENST00000610429	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.05	■■■□□ 2.72
MYO15B-231	ENST00000610429	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.86	■■■□□ 2.69
MYO15B-231	ENST00000610429	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.73	■■■□□ 2.67
MYO15B-231	ENST00000610429	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		31.72	■■■□□ 2.67
MYO15B-231	ENST00000610429	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.57	■■■□□ 2.64
MYO15B-231	ENST00000610429	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.39	■■■□□ 2.61
MYO15B-231	ENST00000610429	SCRIB	Q14160	1630 aa		30.88	■■■□□ 2.53
MYO15B-231	ENST00000610429	CUX2	O14529	1486 aa		30.87	■■■□□ 2.53
MYO15B-231	ENST00000610429	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		30.86	■■■□□ 2.53
MYO15B-231	ENST00000610429	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	30.73	■■■□□ 2.51
MYO15B-231	ENST00000610429	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.45	■■■□□ 2.47
MYO15B-231	ENST00000610429	TRIM41	Q8WV44	630 aa		30.25	■■■□□ 2.43
MYO15B-231	ENST00000610429	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.07	■■■□□ 2.4
MYO15B-231	ENST00000610429	NES	P48681	1621 aa		29.91	■■■□□ 2.38
MYO15B-231	ENST00000610429	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
MYO15B-231	ENST00000610429	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		29.78	■■■□□ 2.36
MYO15B-231	ENST00000610429	HMGXB3	Q12766	1538 aa		29.67	■■■□□ 2.34
MYO15B-231	ENST00000610429	SMARCA2	P51531	1590 aa		29.59	■■■□□ 2.33
MYO15B-231	ENST00000610429	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.51	■■■□□ 2.31
MYO15B-231	ENST00000610429	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.42	■■■□□ 2.3
MYO15B-231	ENST00000610429	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.4	■■■□□ 2.3
MYO15B-231	ENST00000610429	SMARCA4	P51532	1647 aa		29.38	■■■□□ 2.29
MYO15B-231	ENST00000610429	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	29.37	■■■□□ 2.29
MYO15B-231	ENST00000610429	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.29	■■■□□ 2.28
MYO15B-231	ENST00000610429	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	29.26	■■■□□ 2.27
MYO15B-231	ENST00000610429	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.2	■■■□□ 2.26
MYO15B-231	ENST00000610429	WDR62	O43379	1518 aa		29.17	■■■□□ 2.26
MYO15B-231	ENST00000610429	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		29.17	■■■□□ 2.26
MYO15B-231	ENST00000610429	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.09	■■■□□ 2.25
MYO15B-231	ENST00000610429	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.95	■■■□□ 2.23
MYO15B-231	ENST00000610429	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.95	■■■□□ 2.23
MYO15B-231	ENST00000610429	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.95	■■■□□ 2.23
MYO15B-231	ENST00000610429	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MYO15B-231	ENST00000610429	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MYO15B-231	ENST00000610429	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MYO15B-231	ENST00000610429	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
MYO15B-231	ENST00000610429	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		28.72	■■■□□ 2.19
MYO15B-231	ENST00000610429	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
MYO15B-231	ENST00000610429	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.67	■■■□□ 2.18
MYO15B-231	ENST00000610429	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
MYO15B-231	ENST00000610429	CFTR	P13569	1480 aa		28.5	■■■□□ 2.15
MYO15B-231	ENST00000610429	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.41	■■■□□ 2.14
MYO15B-231	ENST00000610429	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
MYO15B-231	ENST00000610429	WIZ	O95785	1651 aa		28.34	■■■□□ 2.13
MYO15B-231	ENST00000610429	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.34	■■■□□ 2.13
MYO15B-231	ENST00000610429	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
MYO15B-231	ENST00000610429	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
MYO15B-231	ENST00000610429	CHD1	O14646	1710 aa		28.09	■■■□□ 2.09
MYO15B-231	ENST00000610429	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.03	■■■□□ 2.08
MYO15B-231	ENST00000610429	FBLN2	P98095	1184 aa		28.02	■■■□□ 2.08
MYO15B-231	ENST00000610429	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28	■■■□□ 2.07
MYO15B-231	ENST00000610429	PRDM2	Q13029	1718 aa		27.95	■■■□□ 2.07
MYO15B-231	ENST00000610429	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
MYO15B-231	ENST00000610429	ABCC8	Q09428	1581 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MYO15B-231	ENST00000610429	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
MYO15B-231	ENST00000610429	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MYO15B-231	ENST00000610429	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MYO15B-231	ENST00000610429	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
MYO15B-231	ENST00000610429	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
MYO15B-231	ENST00000610429	SYNJ1	O43426	1573 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MYO15B-231	ENST00000610429	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MYO15B-231	ENST00000610429	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
MYO15B-231	ENST00000610429	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
MYO15B-231	ENST00000610429	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.64	■■■□□ 2.02
MYO15B-231	ENST00000610429	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		27.64	■■■□□ 2.02
MYO15B-231	ENST00000610429	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		27.6	■■■□□ 2.01
MYO15B-231	ENST00000610429	SOGA1	O94964	1423 aa		27.56	■■■□□ 2
MYO15B-231	ENST00000610429	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
MYO15B-231	ENST00000610429	WDR97	A6NE52	1622 aa		27.51	■■□□□ 1.99
MYO15B-231	ENST00000610429	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.49	■■□□□ 1.99
MYO15B-231	ENST00000610429	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.44	■■□□□ 1.98
MYO15B-231	ENST00000610429	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		27.35	■■□□□ 1.97
MYO15B-231	ENST00000610429	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		27.32	■■□□□ 1.96
MYO15B-231	ENST00000610429	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.31	■■□□□ 1.96
MYO15B-231	ENST00000610429	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		27.28	■■□□□ 1.96
MYO15B-231	ENST00000610429	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.14	■■□□□ 1.94
MYO15B-231	ENST00000610429	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.14	■■□□□ 1.93
MYO15B-231	ENST00000610429	CUX1	P39880	1505 aa		27.11	■■□□□ 1.93
MYO15B-231	ENST00000610429	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		27.11	■■□□□ 1.93
MYO15B-231	ENST00000610429	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		27.08	■■□□□ 1.93
MYO15B-231	ENST00000610429	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.06	■■□□□ 1.92
MYO15B-231	ENST00000610429	NUP160	Q12769	1436 aa		27.06	■■□□□ 1.92
MYO15B-231	ENST00000610429	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.03	■■□□□ 1.92
MYO15B-231	ENST00000610429	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		26.99	■■□□□ 1.91
MYO15B-231	ENST00000610429	KDM6B	O15054	1643 aa		26.98	■■□□□ 1.91
MYO15B-231	ENST00000610429	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		26.97	■■□□□ 1.91
MYO15B-231	ENST00000610429	DIP2B	Q9P265	1576 aa		26.92	■■□□□ 1.9
MYO15B-231	ENST00000610429	MAPKBP1	O60336	1514 aa		26.91	■■□□□ 1.9
MYO15B-231	ENST00000610429	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	26.9	■■□□□ 1.9
MYO15B-231	ENST00000610429	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	26.88	■■□□□ 1.89

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 259.8 ms