RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578923.1

USP2-AS1-205, Transcript of USP2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP2-AS1, Length 895 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2-AS1-205ENST00000578923 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.29■■□□□ 1.16
USP2-AS1-205ENST00000578923 ABCC9O60706 1549 aa21.85■■□□□ 1.09
USP2-AS1-205ENST00000578923 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.69■■□□□ 1.06
USP2-AS1-205ENST00000578923 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.84■□□□□ 0.93
USP2-AS1-205ENST00000578923 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.53■□□□□ 0.88
USP2-AS1-205ENST00000578923 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.19■□□□□ 0.82
USP2-AS1-205ENST00000578923 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
USP2-AS1-205ENST00000578923 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.82■□□□□ 0.76
USP2-AS1-205ENST00000578923 NACADO15069 1562 aa19.74■□□□□ 0.75
USP2-AS1-205ENST00000578923 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.72■□□□□ 0.75
USP2-AS1-205ENST00000578923 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.7■□□□□ 0.74
USP2-AS1-205ENST00000578923 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.66■□□□□ 0.74
USP2-AS1-205ENST00000578923 CUX2O14529 1486 aa19.37■□□□□ 0.69
USP2-AS1-205ENST00000578923 TRIM41Q8WV44 630 aa19.37■□□□□ 0.69
USP2-AS1-205ENST00000578923 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.31■□□□□ 0.68
USP2-AS1-205ENST00000578923 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
USP2-AS1-205ENST00000578923 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.28■□□□□ 0.68
USP2-AS1-205ENST00000578923 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.05■□□□□ 0.64
USP2-AS1-205ENST00000578923 ERCC6Q03468 1493 aa18.95■□□□□ 0.62
USP2-AS1-205ENST00000578923 SCRIBQ14160 1630 aa18.69■□□□□ 0.58
USP2-AS1-205ENST00000578923 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
USP2-AS1-205ENST00000578923 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP2-AS1-205ENST00000578923 NESP48681 1621 aa18.42■□□□□ 0.54
USP2-AS1-205ENST00000578923 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.33■□□□□ 0.52
USP2-AS1-205ENST00000578923 NCAPD3P42695 1498 aa18.26■□□□□ 0.51
USP2-AS1-205ENST00000578923 SMARCA2P51531 1590 aa18.25■□□□□ 0.51
USP2-AS1-205ENST00000578923 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
USP2-AS1-205ENST00000578923 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
USP2-AS1-205ENST00000578923 OSCARQ8IYS5 282 aa18.22■□□□□ 0.51
USP2-AS1-205ENST00000578923 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa18.17■□□□□ 0.5
USP2-AS1-205ENST00000578923 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.17■□□□□ 0.5
USP2-AS1-205ENST00000578923 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.17■□□□□ 0.5
USP2-AS1-205ENST00000578923 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
USP2-AS1-205ENST00000578923 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.09■□□□□ 0.49
USP2-AS1-205ENST00000578923 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
USP2-AS1-205ENST00000578923 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa18.03■□□□□ 0.48
USP2-AS1-205ENST00000578923 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.03■□□□□ 0.48
USP2-AS1-205ENST00000578923 HMGXB3Q12766 1538 aa18.01■□□□□ 0.47
USP2-AS1-205ENST00000578923 ARHGEF11O15085 1522 aa17.99■□□□□ 0.47
USP2-AS1-205ENST00000578923 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.98■□□□□ 0.47
USP2-AS1-205ENST00000578923 WDR62O43379 1518 aa17.93■□□□□ 0.46
USP2-AS1-205ENST00000578923 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.93■□□□□ 0.46
USP2-AS1-205ENST00000578923 CYB5RLQ6IPT4 315 aa17.9■□□□□ 0.46
USP2-AS1-205ENST00000578923 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
USP2-AS1-205ENST00000578923 ARAP1Q96P48 1450 aa17.75■□□□□ 0.43
USP2-AS1-205ENST00000578923 SMARCA4P51532 1647 aa17.67■□□□□ 0.42
USP2-AS1-205ENST00000578923 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.64■□□□□ 0.41
USP2-AS1-205ENST00000578923 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.58■□□□□ 0.41
USP2-AS1-205ENST00000578923 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.51■□□□□ 0.39
USP2-AS1-205ENST00000578923 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
USP2-AS1-205ENST00000578923 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.45■□□□□ 0.38
USP2-AS1-205ENST00000578923 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
USP2-AS1-205ENST00000578923 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
USP2-AS1-205ENST00000578923 CHD1O14646 1710 aa17.32■□□□□ 0.36
USP2-AS1-205ENST00000578923 IFT140Q96RY7 1462 aa17.28■□□□□ 0.36
USP2-AS1-205ENST00000578923 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa17.27■□□□□ 0.36
USP2-AS1-205ENST00000578923 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
USP2-AS1-205ENST00000578923 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.18■□□□□ 0.34
USP2-AS1-205ENST00000578923 CFTRP13569 1480 aa17.18■□□□□ 0.34
USP2-AS1-205ENST00000578923 FBLN2P98095 1184 aa17.17■□□□□ 0.34
USP2-AS1-205ENST00000578923 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.13■□□□□ 0.33
USP2-AS1-205ENST00000578923 FBXO41Q8TF61 875 aa17.1■□□□□ 0.33
USP2-AS1-205ENST00000578923 ERCC6L2Q5T890 1561 aa17.09■□□□□ 0.33
USP2-AS1-205ENST00000578923 LMTK3Q96Q04 1460 aa17.08■□□□□ 0.32
USP2-AS1-205ENST00000578923 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.06■□□□□ 0.32
USP2-AS1-205ENST00000578923 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.05■□□□□ 0.32
USP2-AS1-205ENST00000578923 HECW2Q9P2P5 1572 aa17.01■□□□□ 0.31
USP2-AS1-205ENST00000578923 KIF13AQ9H1H9 1805 aa16.98■□□□□ 0.31
USP2-AS1-205ENST00000578923 TOPBP1Q92547 1522 aa16.97■□□□□ 0.31
USP2-AS1-205ENST00000578923 SOCS7O14512 581 aa16.97■□□□□ 0.31
USP2-AS1-205ENST00000578923 SYNJ1O43426 1573 aa16.96■□□□□ 0.31
USP2-AS1-205ENST00000578923 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
USP2-AS1-205ENST00000578923 ILDR2Q71H61 639 aa16.89■□□□□ 0.29
USP2-AS1-205ENST00000578923 WIZO95785 1651 aa16.88■□□□□ 0.29
USP2-AS1-205ENST00000578923 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.86■□□□□ 0.29
USP2-AS1-205ENST00000578923 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
USP2-AS1-205ENST00000578923 KDM6BO15054 1643 aa16.82■□□□□ 0.28
USP2-AS1-205ENST00000578923 PRDM2Q13029 1718 aa16.82■□□□□ 0.28
USP2-AS1-205ENST00000578923 SYNJ2O15056 1496 aa16.81■□□□□ 0.28
USP2-AS1-205ENST00000578923 ADGRL1O94910 1474 aa16.81■□□□□ 0.28
USP2-AS1-205ENST00000578923 ABCC8Q09428 1581 aa16.79■□□□□ 0.28
USP2-AS1-205ENST00000578923 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.78■□□□□ 0.28
USP2-AS1-205ENST00000578923 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
USP2-AS1-205ENST00000578923 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
USP2-AS1-205ENST00000578923 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.74■□□□□ 0.27
USP2-AS1-205ENST00000578923 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.73■□□□□ 0.27
USP2-AS1-205ENST00000578923 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
USP2-AS1-205ENST00000578923 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.69■□□□□ 0.26
USP2-AS1-205ENST00000578923 DISP3Q9P2K9 1392 aa16.69■□□□□ 0.26
USP2-AS1-205ENST00000578923 DIP2BQ9P265 1576 aa16.65■□□□□ 0.26
USP2-AS1-205ENST00000578923 WDR97A6NE52 1622 aa16.63■□□□□ 0.25
USP2-AS1-205ENST00000578923 GRIN2BQ13224 1484 aa16.61■□□□□ 0.25
USP2-AS1-205ENST00000578923 CEP170Q5SW79 1584 aa16.6■□□□□ 0.25
USP2-AS1-205ENST00000578923 SOGA1O94964 1423 aa16.59■□□□□ 0.25
USP2-AS1-205ENST00000578923 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
USP2-AS1-205ENST00000578923 MAPKBP1O60336 1514 aa16.56■□□□□ 0.24
USP2-AS1-205ENST00000578923 TSPOAP1O95153 1857 aa16.54■□□□□ 0.24
USP2-AS1-205ENST00000578923 SHROOM2Q13796 1616 aa16.48■□□□□ 0.23
USP2-AS1-205ENST00000578923 PBRM1Q86U86 1689 aa16.43■□□□□ 0.22
USP2-AS1-205ENST00000578923 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms