RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551173.5

CD63-211, Transcript of CD63 molecule, humanhuman

TSL 3

Gene CD63, Length 788 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63-211ENST00000551173 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.12■■■■■ 5.61
CD63-211ENST00000551173 ABCC9O60706 1549 aa46.85■■■■■ 5.09
CD63-211ENST00000551173 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.62■■■■■ 4.89
CD63-211ENST00000551173 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.08■■■■■ 4.81
CD63-211ENST00000551173 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.06■■■■■ 4.64
CD63-211ENST00000551173 NACADO15069 1562 aa43.43■■■■■ 4.54
CD63-211ENST00000551173 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.38■■■■■ 4.53
CD63-211ENST00000551173 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.07■■■■■ 4.49
CD63-211ENST00000551173 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.88■■■■■ 4.45
CD63-211ENST00000551173 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.78■■■■■ 4.44
CD63-211ENST00000551173 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.42■■■■■ 4.38
CD63-211ENST00000551173 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.38■■■■■ 4.37
CD63-211ENST00000551173 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.36■■■■■ 4.37
CD63-211ENST00000551173 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.29■■■■■ 4.36
CD63-211ENST00000551173 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.12■■■■■ 4.33
CD63-211ENST00000551173 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
CD63-211ENST00000551173 SCRIBQ14160 1630 aa41.44■■■■■ 4.22
CD63-211ENST00000551173 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.34■■■■■ 4.21
CD63-211ENST00000551173 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
CD63-211ENST00000551173 CUX2O14529 1486 aa40.97■■■■■ 4.15
CD63-211ENST00000551173 ERCC6Q03468 1493 aa40.59■■■■■ 4.09
CD63-211ENST00000551173 NCAPD3P42695 1498 aa40.07■■■■■ 4.01
CD63-211ENST00000551173 TRIM41Q8WV44 630 aa40.02■■■■■ 4
CD63-211ENST00000551173 NESP48681 1621 aa39.85■■■■□ 3.97
CD63-211ENST00000551173 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
CD63-211ENST00000551173 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.76■■■■□ 3.96
CD63-211ENST00000551173 HMGXB3Q12766 1538 aa39.69■■■■□ 3.94
CD63-211ENST00000551173 SMARCA2P51531 1590 aa39.62■■■■□ 3.93
CD63-211ENST00000551173 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.42■■■■□ 3.9
CD63-211ENST00000551173 SMARCA4P51532 1647 aa39.41■■■■□ 3.9
CD63-211ENST00000551173 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.35■■■■□ 3.89
CD63-211ENST00000551173 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
CD63-211ENST00000551173 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.23■■■■□ 3.87
CD63-211ENST00000551173 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.04■■■■□ 3.84
CD63-211ENST00000551173 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
CD63-211ENST00000551173 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.97■■■■□ 3.83
CD63-211ENST00000551173 WDR62O43379 1518 aa38.92■■■■□ 3.82
CD63-211ENST00000551173 OSCARQ8IYS5 282 aa38.85■■■■□ 3.81
CD63-211ENST00000551173 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.79■■■■□ 3.8
CD63-211ENST00000551173 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.59■■■■□ 3.77
CD63-211ENST00000551173 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.55■■■■□ 3.76
CD63-211ENST00000551173 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.52■■■■□ 3.76
CD63-211ENST00000551173 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.52■■■■□ 3.76
CD63-211ENST00000551173 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.52■■■■□ 3.76
CD63-211ENST00000551173 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.37■■■■□ 3.73
CD63-211ENST00000551173 ARHGEF11O15085 1522 aa38.25■■■■□ 3.71
CD63-211ENST00000551173 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
CD63-211ENST00000551173 WIZO95785 1651 aa38.09■■■■□ 3.69
CD63-211ENST00000551173 CFTRP13569 1480 aa38.08■■■■□ 3.69
CD63-211ENST00000551173 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
CD63-211ENST00000551173 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.03■■■■□ 3.68
CD63-211ENST00000551173 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.97■■■■□ 3.67
CD63-211ENST00000551173 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
CD63-211ENST00000551173 IFT140Q96RY7 1462 aa37.83■■■■□ 3.65
CD63-211ENST00000551173 ARAP1Q96P48 1450 aa37.77■■■■□ 3.64
CD63-211ENST00000551173 PRDM2Q13029 1718 aa37.67■■■■□ 3.62
CD63-211ENST00000551173 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.61
CD63-211ENST00000551173 CHD1O14646 1710 aa37.62■■■■□ 3.61
CD63-211ENST00000551173 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
CD63-211ENST00000551173 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
CD63-211ENST00000551173 TOPBP1Q92547 1522 aa37.5■■■■□ 3.59
CD63-211ENST00000551173 FBLN2P98095 1184 aa37.4■■■■□ 3.58
CD63-211ENST00000551173 ABCC8Q09428 1581 aa37.36■■■■□ 3.57
CD63-211ENST00000551173 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.35■■■■□ 3.573e-9■■■■■ 37.1
CD63-211ENST00000551173 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
CD63-211ENST00000551173 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.25■■■■□ 3.55
CD63-211ENST00000551173 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.12■■■■□ 3.53
CD63-211ENST00000551173 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.08■■■■□ 3.53
CD63-211ENST00000551173 SYNJ1O43426 1573 aa37.02■■■■□ 3.52
CD63-211ENST00000551173 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.01■■■■□ 3.52
CD63-211ENST00000551173 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.95■■■■□ 3.51
CD63-211ENST00000551173 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
CD63-211ENST00000551173 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
CD63-211ENST00000551173 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.89■■■■□ 3.5
CD63-211ENST00000551173 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.84■■■■□ 3.49
CD63-211ENST00000551173 WDR97A6NE52 1622 aa36.84■■■■□ 3.49
CD63-211ENST00000551173 SOGA1O94964 1423 aa36.83■■■■□ 3.49
CD63-211ENST00000551173 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.49
CD63-211ENST00000551173 SYNJ2O15056 1496 aa36.71■■■■□ 3.47
CD63-211ENST00000551173 GRIN2BQ13224 1484 aa36.68■■■■□ 3.46
CD63-211ENST00000551173 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.6■■■■□ 3.45
CD63-211ENST00000551173 PBRM1Q86U86 1689 aa36.48■■■■□ 3.43
CD63-211ENST00000551173 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
CD63-211ENST00000551173 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.43■■■■□ 3.42
CD63-211ENST00000551173 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.42■■■■□ 3.42
CD63-211ENST00000551173 CUX1P39880 1505 aa36.34■■■■□ 3.41
CD63-211ENST00000551173 CEP170Q5SW79 1584 aa36.27■■■■□ 3.4
CD63-211ENST00000551173 GRIN2AQ12879 1464 aa36.2■■■■□ 3.39
CD63-211ENST00000551173 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.19■■■■□ 3.38
CD63-211ENST00000551173 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.15■■■■□ 3.38
CD63-211ENST00000551173 SHROOM2Q13796 1616 aa36.13■■■■□ 3.37
CD63-211ENST00000551173 NUP160Q12769 1436 aa36.12■■■■□ 3.37
CD63-211ENST00000551173 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.12■■■■□ 3.37
CD63-211ENST00000551173 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.05■■■■□ 3.36
CD63-211ENST00000551173 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.03■■■■□ 3.36
CD63-211ENST00000551173 ADAMTS12P58397 1594 aa36.02■■■■□ 3.36
CD63-211ENST00000551173 KDM6BO15054 1643 aa35.98■■■■□ 3.35
CD63-211ENST00000551173 DIP2BQ9P265 1576 aa35.91■■■■□ 3.34
CD63-211ENST00000551173 MAPKBP1O60336 1514 aa35.89■■■■□ 3.34
CD63-211ENST00000551173 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms