RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548245.5

VEZT-215, Transcript of vezatin, adherens junctions transmembrane protein, humanhuman

TSL 3

Gene VEZT, Length 588 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEZT-215ENST00000548245 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.93■■□□□ 1.74
VEZT-215ENST00000548245 ABCC9O60706 1549 aa24.68■■□□□ 1.54
VEZT-215ENST00000548245 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.02■■□□□ 1.44
VEZT-215ENST00000548245 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.49■■□□□ 1.35
VEZT-215ENST00000548245 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
VEZT-215ENST00000548245 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.89■■□□□ 1.26
VEZT-215ENST00000548245 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.58■■□□□ 1.21
VEZT-215ENST00000548245 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.58■■□□□ 1.21
VEZT-215ENST00000548245 NACADO15069 1562 aa22.49■■□□□ 1.19
VEZT-215ENST00000548245 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.33■■□□□ 1.17
VEZT-215ENST00000548245 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.31■■□□□ 1.16
VEZT-215ENST00000548245 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.26■■□□□ 1.15
VEZT-215ENST00000548245 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.12■■□□□ 1.13
VEZT-215ENST00000548245 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
VEZT-215ENST00000548245 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.8■■□□□ 1.08
VEZT-215ENST00000548245 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.73■■□□□ 1.07
VEZT-215ENST00000548245 SCRIBQ14160 1630 aa21.59■■□□□ 1.05
VEZT-215ENST00000548245 CUX2O14529 1486 aa21.45■■□□□ 1.02
VEZT-215ENST00000548245 TRIM41Q8WV44 630 aa21.4■■□□□ 1.02
VEZT-215ENST00000548245 ERCC6Q03468 1493 aa21.32■■□□□ 1
VEZT-215ENST00000548245 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
VEZT-215ENST00000548245 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.22■□□□□ 0.99
VEZT-215ENST00000548245 NESP48681 1621 aa20.95■□□□□ 0.94
VEZT-215ENST00000548245 NCAPD3P42695 1498 aa20.83■□□□□ 0.93
VEZT-215ENST00000548245 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
VEZT-215ENST00000548245 SMARCA2P51531 1590 aa20.7■□□□□ 0.9
VEZT-215ENST00000548245 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.69■□□□□ 0.9
VEZT-215ENST00000548245 HMGXB3Q12766 1538 aa20.53■□□□□ 0.88
VEZT-215ENST00000548245 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.5■□□□□ 0.87
VEZT-215ENST00000548245 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
VEZT-215ENST00000548245 OSCARQ8IYS5 282 aa20.45■□□□□ 0.86
VEZT-215ENST00000548245 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.45■□□□□ 0.86
VEZT-215ENST00000548245 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.44■□□□□ 0.86
VEZT-215ENST00000548245 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
VEZT-215ENST00000548245 SMARCA4P51532 1647 aa20.4■□□□□ 0.86
VEZT-215ENST00000548245 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.34■□□□□ 0.85
VEZT-215ENST00000548245 WDR62O43379 1518 aa20.27■□□□□ 0.83
VEZT-215ENST00000548245 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
VEZT-215ENST00000548245 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
VEZT-215ENST00000548245 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.23■□□□□ 0.83
VEZT-215ENST00000548245 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.23■□□□□ 0.83
VEZT-215ENST00000548245 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.23■□□□□ 0.83
VEZT-215ENST00000548245 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.21■□□□□ 0.83
VEZT-215ENST00000548245 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.14■□□□□ 0.81
VEZT-215ENST00000548245 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.11■□□□□ 0.81
VEZT-215ENST00000548245 ARHGEF11O15085 1522 aa20.09■□□□□ 0.81
VEZT-215ENST00000548245 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.08■□□□□ 0.81
VEZT-215ENST00000548245 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.05■□□□□ 0.8
VEZT-215ENST00000548245 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.01■□□□□ 0.79
VEZT-215ENST00000548245 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
VEZT-215ENST00000548245 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
VEZT-215ENST00000548245 ARAP1Q96P48 1450 aa19.86■□□□□ 0.77
VEZT-215ENST00000548245 CFTRP13569 1480 aa19.76■□□□□ 0.75
VEZT-215ENST00000548245 WIZO95785 1651 aa19.75■□□□□ 0.75
VEZT-215ENST00000548245 FBLN2P98095 1184 aa19.73■□□□□ 0.75
VEZT-215ENST00000548245 IFT140Q96RY7 1462 aa19.69■□□□□ 0.74
VEZT-215ENST00000548245 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
VEZT-215ENST00000548245 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
VEZT-215ENST00000548245 CHD1O14646 1710 aa19.59■□□□□ 0.73
VEZT-215ENST00000548245 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.59■□□□□ 0.737e-6■■□□□ 13.5
VEZT-215ENST00000548245 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
VEZT-215ENST00000548245 TOPBP1Q92547 1522 aa19.51■□□□□ 0.71
VEZT-215ENST00000548245 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
VEZT-215ENST00000548245 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.35■□□□□ 0.69
VEZT-215ENST00000548245 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
VEZT-215ENST00000548245 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
VEZT-215ENST00000548245 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
VEZT-215ENST00000548245 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.31■□□□□ 0.68
VEZT-215ENST00000548245 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.3■□□□□ 0.68
VEZT-215ENST00000548245 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.3■□□□□ 0.68
VEZT-215ENST00000548245 PRDM2Q13029 1718 aa19.3■□□□□ 0.68
VEZT-215ENST00000548245 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.29■□□□□ 0.68
VEZT-215ENST00000548245 ABCC8Q09428 1581 aa19.28■□□□□ 0.68
VEZT-215ENST00000548245 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
VEZT-215ENST00000548245 SYNJ1O43426 1573 aa19.25■□□□□ 0.67
VEZT-215ENST00000548245 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.25■□□□□ 0.67
VEZT-215ENST00000548245 SOGA1O94964 1423 aa19.19■□□□□ 0.66
VEZT-215ENST00000548245 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa19.18■□□□□ 0.66
VEZT-215ENST00000548245 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.12■□□□□ 0.65
VEZT-215ENST00000548245 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
VEZT-215ENST00000548245 SYNJ2O15056 1496 aa19.1■□□□□ 0.65
VEZT-215ENST00000548245 GRIN2BQ13224 1484 aa19.07■□□□□ 0.64
VEZT-215ENST00000548245 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.03■□□□□ 0.64
VEZT-215ENST00000548245 FAM69CQ0P6D2 419 aa19■□□□□ 0.63
VEZT-215ENST00000548245 KIF13AQ9H1H9 1805 aa18.99■□□□□ 0.63
VEZT-215ENST00000548245 WDR97A6NE52 1622 aa18.93■□□□□ 0.62
VEZT-215ENST00000548245 CEP170Q5SW79 1584 aa18.91■□□□□ 0.62
VEZT-215ENST00000548245 CUX1P39880 1505 aa18.87■□□□□ 0.61
VEZT-215ENST00000548245 PBRM1Q86U86 1689 aa18.86■□□□□ 0.61
VEZT-215ENST00000548245 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.84■□□□□ 0.61
VEZT-215ENST00000548245 KDM6BO15054 1643 aa18.84■□□□□ 0.61
VEZT-215ENST00000548245 GRIN2AQ12879 1464 aa18.84■□□□□ 0.61
VEZT-215ENST00000548245 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.79■□□□□ 0.6
VEZT-215ENST00000548245 NUP160Q12769 1436 aa18.78■□□□□ 0.6
VEZT-215ENST00000548245 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
VEZT-215ENST00000548245 HECW2Q9P2P5 1572 aa18.76■□□□□ 0.59
VEZT-215ENST00000548245 ADGRL1O94910 1474 aa18.75■□□□□ 0.59
VEZT-215ENST00000548245 DIP2BQ9P265 1576 aa18.75■□□□□ 0.59
VEZT-215ENST00000548245 SHROOM2Q13796 1616 aa18.73■□□□□ 0.59
VEZT-215ENST00000548245 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms