RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512673.1

ALYREF-204, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 2

Gene ALYREF, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-204ENST00000512673 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.37■■■■■ 4.05
ALYREF-204ENST00000512673 ABCC9O60706 1549 aa37.83■■■■□ 3.65
ALYREF-204ENST00000512673 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.59■■■■□ 3.45
ALYREF-204ENST00000512673 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.46■■■■□ 3.43
ALYREF-204ENST00000512673 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.38■■■■□ 3.25
ALYREF-204ENST00000512673 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.11■■■■□ 3.21
ALYREF-204ENST00000512673 NACADO15069 1562 aa34.84■■■■□ 3.17
ALYREF-204ENST00000512673 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.72■■■■□ 3.15
ALYREF-204ENST00000512673 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.67■■■■□ 3.14
ALYREF-204ENST00000512673 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.48■■■■□ 3.11
ALYREF-204ENST00000512673 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.11■■■■□ 3.05
ALYREF-204ENST00000512673 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.1■■■■□ 3.05
ALYREF-204ENST00000512673 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.05■■■■□ 3.04
ALYREF-204ENST00000512673 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.92■■■■□ 3.02
ALYREF-204ENST00000512673 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
ALYREF-204ENST00000512673 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.66■■■□□ 2.98
ALYREF-204ENST00000512673 SCRIBQ14160 1630 aa33.47■■■□□ 2.95
ALYREF-204ENST00000512673 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
ALYREF-204ENST00000512673 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.14■■■□□ 2.9
ALYREF-204ENST00000512673 CUX2O14529 1486 aa32.86■■■□□ 2.85
ALYREF-204ENST00000512673 ERCC6Q03468 1493 aa32.67■■■□□ 2.82
ALYREF-204ENST00000512673 TRIM41Q8WV44 630 aa32.35■■■□□ 2.77
ALYREF-204ENST00000512673 NESP48681 1621 aa32.22■■■□□ 2.75
ALYREF-204ENST00000512673 NCAPD3P42695 1498 aa32.21■■■□□ 2.75
ALYREF-204ENST00000512673 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.03■■■□□ 2.72
ALYREF-204ENST00000512673 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
ALYREF-204ENST00000512673 HMGXB3Q12766 1538 aa31.86■■■□□ 2.69
ALYREF-204ENST00000512673 SMARCA2P51531 1590 aa31.85■■■□□ 2.69
ALYREF-204ENST00000512673 SMARCA4P51532 1647 aa31.74■■■□□ 2.67
ALYREF-204ENST00000512673 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.72■■■□□ 2.67
ALYREF-204ENST00000512673 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
ALYREF-204ENST00000512673 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.64■■■□□ 2.65
ALYREF-204ENST00000512673 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.5■■■□□ 2.63
ALYREF-204ENST00000512673 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
ALYREF-204ENST00000512673 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.34■■■□□ 2.61
ALYREF-204ENST00000512673 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.34■■■□□ 2.61
ALYREF-204ENST00000512673 WDR62O43379 1518 aa31.29■■■□□ 2.6
ALYREF-204ENST00000512673 OSCARQ8IYS5 282 aa31.24■■■□□ 2.59
ALYREF-204ENST00000512673 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.21■■■□□ 2.59
ALYREF-204ENST00000512673 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.17■■■□□ 2.58
ALYREF-204ENST00000512673 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.01■■■□□ 2.56
ALYREF-204ENST00000512673 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.01■■■□□ 2.55
ALYREF-204ENST00000512673 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.01■■■□□ 2.55
ALYREF-204ENST00000512673 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.01■■■□□ 2.55
ALYREF-204ENST00000512673 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.9■■■□□ 2.54
ALYREF-204ENST00000512673 ARHGEF11O15085 1522 aa30.78■■■□□ 2.52
ALYREF-204ENST00000512673 WIZO95785 1651 aa30.77■■■□□ 2.52
ALYREF-204ENST00000512673 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
ALYREF-204ENST00000512673 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
ALYREF-204ENST00000512673 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.69■■■□□ 2.5
ALYREF-204ENST00000512673 CFTRP13569 1480 aa30.63■■■□□ 2.49
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
ALYREF-204ENST00000512673 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
ALYREF-204ENST00000512673 ARAP1Q96P48 1450 aa30.44■■■□□ 2.46
ALYREF-204ENST00000512673 IFT140Q96RY7 1462 aa30.4■■■□□ 2.46
ALYREF-204ENST00000512673 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
ALYREF-204ENST00000512673 CHD1O14646 1710 aa30.3■■■□□ 2.44
ALYREF-204ENST00000512673 FBLN2P98095 1184 aa30.22■■■□□ 2.43
ALYREF-204ENST00000512673 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
ALYREF-204ENST00000512673 PRDM2Q13029 1718 aa30.21■■■□□ 2.43
ALYREF-204ENST00000512673 TOPBP1Q92547 1522 aa30.21■■■□□ 2.43
ALYREF-204ENST00000512673 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.17■■■□□ 2.421e-7■■■■■ 35.8
ALYREF-204ENST00000512673 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
ALYREF-204ENST00000512673 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
ALYREF-204ENST00000512673 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.97■■■□□ 2.39
ALYREF-204ENST00000512673 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.93■■■□□ 2.38
ALYREF-204ENST00000512673 ABCC8Q09428 1581 aa29.92■■■□□ 2.38
ALYREF-204ENST00000512673 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.87■■■□□ 2.37
ALYREF-204ENST00000512673 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
ALYREF-204ENST00000512673 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.83■■■□□ 2.37
ALYREF-204ENST00000512673 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
ALYREF-204ENST00000512673 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.8■■■□□ 2.36
ALYREF-204ENST00000512673 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
ALYREF-204ENST00000512673 SYNJ1O43426 1573 aa29.73■■■□□ 2.35
ALYREF-204ENST00000512673 SOGA1O94964 1423 aa29.68■■■□□ 2.34
ALYREF-204ENST00000512673 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.67■■■□□ 2.34
ALYREF-204ENST00000512673 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
ALYREF-204ENST00000512673 SYNJ2O15056 1496 aa29.53■■■□□ 2.32
ALYREF-204ENST00000512673 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.53■■■□□ 2.32
ALYREF-204ENST00000512673 GRIN2BQ13224 1484 aa29.49■■■□□ 2.31
ALYREF-204ENST00000512673 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.47■■■□□ 2.31
ALYREF-204ENST00000512673 WDR97A6NE52 1622 aa29.45■■■□□ 2.31
ALYREF-204ENST00000512673 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
ALYREF-204ENST00000512673 PBRM1Q86U86 1689 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-204ENST00000512673 CUX1P39880 1505 aa29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-204ENST00000512673 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-204ENST00000512673 CEP170Q5SW79 1584 aa29.22■■■□□ 2.27
ALYREF-204ENST00000512673 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.17■■■□□ 2.26
ALYREF-204ENST00000512673 GRIN2AQ12879 1464 aa29.15■■■□□ 2.26
ALYREF-204ENST00000512673 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.13■■■□□ 2.25
ALYREF-204ENST00000512673 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.07■■■□□ 2.24
ALYREF-204ENST00000512673 NUP160Q12769 1436 aa29.06■■■□□ 2.24
ALYREF-204ENST00000512673 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.05■■■□□ 2.24
ALYREF-204ENST00000512673 SHROOM2Q13796 1616 aa29.04■■■□□ 2.24
ALYREF-204ENST00000512673 ADAMTS12P58397 1594 aa29.01■■■□□ 2.24
ALYREF-204ENST00000512673 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.97■■■□□ 2.23
ALYREF-204ENST00000512673 KDM6BO15054 1643 aa28.94■■■□□ 2.22
ALYREF-204ENST00000512673 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
ALYREF-204ENST00000512673 DIP2BQ9P265 1576 aa28.89■■■□□ 2.22
ALYREF-204ENST00000512673 TSPOAP1O95153 1857 aa28.85■■■□□ 2.21
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