RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510186.5

FAM200B-216, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM200B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200B-216ENST00000510186 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.89■■■□□ 2.22
FAM200B-216ENST00000510186 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
FAM200B-216ENST00000510186 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.74■■□□□ 1.71
FAM200B-216ENST00000510186 ABCC9O60706 1549 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM200B-216ENST00000510186 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.01■■□□□ 1.59
FAM200B-216ENST00000510186 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.33■■□□□ 1.48
FAM200B-216ENST00000510186 NACADO15069 1562 aa24.29■■□□□ 1.48
FAM200B-216ENST00000510186 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.15■■□□□ 1.46
FAM200B-216ENST00000510186 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.15■■□□□ 1.46
FAM200B-216ENST00000510186 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
FAM200B-216ENST00000510186 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.96■■□□□ 1.43
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FAM200B-216ENST00000510186 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
FAM200B-216ENST00000510186 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.55■■□□□ 1.36
FAM200B-216ENST00000510186 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.43■■□□□ 1.34
FAM200B-216ENST00000510186 SCRIBQ14160 1630 aa23.39■■□□□ 1.33
FAM200B-216ENST00000510186 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.38■■□□□ 1.33
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FAM200B-216ENST00000510186 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.88■■□□□ 1.25
FAM200B-216ENST00000510186 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.79■■□□□ 1.24
FAM200B-216ENST00000510186 NCAPD3P42695 1498 aa22.43■■□□□ 1.18
FAM200B-216ENST00000510186 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
FAM200B-216ENST00000510186 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
FAM200B-216ENST00000510186 SMARCA4P51532 1647 aa22.41■■□□□ 1.18
FAM200B-216ENST00000510186 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM200B-216ENST00000510186 SMARCA2P51531 1590 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM200B-216ENST00000510186 HMGXB3Q12766 1538 aa22.27■■□□□ 1.16
FAM200B-216ENST00000510186 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.26■■□□□ 1.15
FAM200B-216ENST00000510186 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.22■■□□□ 1.15
FAM200B-216ENST00000510186 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
FAM200B-216ENST00000510186 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
FAM200B-216ENST00000510186 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
FAM200B-216ENST00000510186 WIZO95785 1651 aa21.92■■□□□ 1.1
FAM200B-216ENST00000510186 ERCC6Q03468 1493 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM200B-216ENST00000510186 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM200B-216ENST00000510186 NESP48681 1621 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM200B-216ENST00000510186 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
FAM200B-216ENST00000510186 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.75■■□□□ 1.07
FAM200B-216ENST00000510186 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.72■■□□□ 1.07
FAM200B-216ENST00000510186 CUX2O14529 1486 aa21.72■■□□□ 1.07
FAM200B-216ENST00000510186 CFTRP13569 1480 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM200B-216ENST00000510186 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
FAM200B-216ENST00000510186 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.53■■□□□ 1.04
FAM200B-216ENST00000510186 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.5■■□□□ 1.03
FAM200B-216ENST00000510186 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM200B-216ENST00000510186 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM200B-216ENST00000510186 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.45■■□□□ 1.03
FAM200B-216ENST00000510186 WDR62O43379 1518 aa21.39■■□□□ 1.02
FAM200B-216ENST00000510186 PRDM2Q13029 1718 aa21.29■■□□□ 1
FAM200B-216ENST00000510186 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.26■□□□□ 0.99
FAM200B-216ENST00000510186 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
FAM200B-216ENST00000510186 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
FAM200B-216ENST00000510186 ABCC8Q09428 1581 aa21.18■□□□□ 0.98
FAM200B-216ENST00000510186 TOPBP1Q92547 1522 aa21.09■□□□□ 0.97
FAM200B-216ENST00000510186 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.06■□□□□ 0.96
FAM200B-216ENST00000510186 IFT140Q96RY7 1462 aa21.04■□□□□ 0.96
FAM200B-216ENST00000510186 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
FAM200B-216ENST00000510186 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
FAM200B-216ENST00000510186 FOXD1Q16676 465 aa20.88■□□□□ 0.93
FAM200B-216ENST00000510186 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
FAM200B-216ENST00000510186 CUX1P39880 1505 aa20.85■□□□□ 0.93
FAM200B-216ENST00000510186 SOGA1O94964 1423 aa20.85■□□□□ 0.93
FAM200B-216ENST00000510186 OSCARQ8IYS5 282 aa20.82■□□□□ 0.92
FAM200B-216ENST00000510186 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.81■□□□□ 0.92
FAM200B-216ENST00000510186 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
FAM200B-216ENST00000510186 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.78■□□□□ 0.92
FAM200B-216ENST00000510186 WDR97A6NE52 1622 aa20.77■□□□□ 0.92
FAM200B-216ENST00000510186 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.76■□□□□ 0.91
FAM200B-216ENST00000510186 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
FAM200B-216ENST00000510186 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.9
FAM200B-216ENST00000510186 TOP2BQ02880 1626 aa20.65■□□□□ 0.9
FAM200B-216ENST00000510186 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.65■□□□□ 0.9
FAM200B-216ENST00000510186 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.64■□□□□ 0.89
FAM200B-216ENST00000510186 GRIN2BQ13224 1484 aa20.62■□□□□ 0.89
FAM200B-216ENST00000510186 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
FAM200B-216ENST00000510186 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.59■□□□□ 0.89
FAM200B-216ENST00000510186 SYNJ1O43426 1573 aa20.59■□□□□ 0.89
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FAM200B-216ENST00000510186 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM200B-216ENST00000510186 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-216ENST00000510186 SYNJ2O15056 1496 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-216ENST00000510186 CHD1O14646 1710 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-216ENST00000510186 PBRM1Q86U86 1689 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM200B-216ENST00000510186 ARHGEF11O15085 1522 aa20.41■□□□□ 0.86
FAM200B-216ENST00000510186 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.41■□□□□ 0.86
FAM200B-216ENST00000510186 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.39■□□□□ 0.86
FAM200B-216ENST00000510186 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.39■□□□□ 0.86
FAM200B-216ENST00000510186 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.39■□□□□ 0.86
FAM200B-216ENST00000510186 TRIM41Q8WV44 630 aa20.39■□□□□ 0.85
FAM200B-216ENST00000510186 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.37■□□□□ 0.85
FAM200B-216ENST00000510186 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.37■□□□□ 0.85
FAM200B-216ENST00000510186 ADAMTS12P58397 1594 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM200B-216ENST00000510186 GRIN2AQ12879 1464 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM200B-216ENST00000510186 KIF27Q86VH2 1401 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-216ENST00000510186 NUP160Q12769 1436 aa20.27■□□□□ 0.84
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FAM200B-216ENST00000510186 CEP170Q5SW79 1584 aa20.2■□□□□ 0.82
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