RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503062.1

ADD1-208, Transcript of adducin 1, humanhuman

TSL 2

Gene ADD1, Length 488 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADD1-208ENST00000503062 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29■■■□□ 2.23
ADD1-208ENST00000503062 ABCC9O60706 1549 aa27.31■■□□□ 1.96
ADD1-208ENST00000503062 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.43■■□□□ 1.82
ADD1-208ENST00000503062 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.36■■□□□ 1.81
ADD1-208ENST00000503062 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.59■■□□□ 1.69
ADD1-208ENST00000503062 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
ADD1-208ENST00000503062 NACADO15069 1562 aa25.18■■□□□ 1.62
ADD1-208ENST00000503062 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.02■■□□□ 1.6
ADD1-208ENST00000503062 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.9■■□□□ 1.58
ADD1-208ENST00000503062 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.86■■□□□ 1.57
ADD1-208ENST00000503062 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.86■■□□□ 1.57
ADD1-208ENST00000503062 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.69■■□□□ 1.54
ADD1-208ENST00000503062 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.61■■□□□ 1.53
ADD1-208ENST00000503062 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.52■■□□□ 1.52
ADD1-208ENST00000503062 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.43■■□□□ 1.5
ADD1-208ENST00000503062 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
ADD1-208ENST00000503062 SCRIBQ14160 1630 aa24.06■■□□□ 1.44
ADD1-208ENST00000503062 CUX2O14529 1486 aa23.88■■□□□ 1.41
ADD1-208ENST00000503062 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.88■■□□□ 1.41
ADD1-208ENST00000503062 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
ADD1-208ENST00000503062 ERCC6Q03468 1493 aa23.66■■□□□ 1.38
ADD1-208ENST00000503062 TRIM41Q8WV44 630 aa23.46■■□□□ 1.35
ADD1-208ENST00000503062 NCAPD3P42695 1498 aa23.24■■□□□ 1.31
ADD1-208ENST00000503062 NESP48681 1621 aa23.19■■□□□ 1.3
ADD1-208ENST00000503062 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
ADD1-208ENST00000503062 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.06■■□□□ 1.28
ADD1-208ENST00000503062 HMGXB3Q12766 1538 aa23.01■■□□□ 1.27
ADD1-208ENST00000503062 SMARCA2P51531 1590 aa22.98■■□□□ 1.27
ADD1-208ENST00000503062 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.89■■□□□ 1.25
ADD1-208ENST00000503062 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.88■■□□□ 1.25
ADD1-208ENST00000503062 SMARCA4P51532 1647 aa22.83■■□□□ 1.25
ADD1-208ENST00000503062 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ADD1-208ENST00000503062 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.79■■□□□ 1.24
ADD1-208ENST00000503062 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
ADD1-208ENST00000503062 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.65■■□□□ 1.22
ADD1-208ENST00000503062 OSCARQ8IYS5 282 aa22.63■■□□□ 1.21
ADD1-208ENST00000503062 WDR62O43379 1518 aa22.62■■□□□ 1.21
ADD1-208ENST00000503062 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.59■■□□□ 1.21
ADD1-208ENST00000503062 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.5■■□□□ 1.19
ADD1-208ENST00000503062 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.46■■□□□ 1.19
ADD1-208ENST00000503062 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.46■■□□□ 1.19
ADD1-208ENST00000503062 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.46■■□□□ 1.19
ADD1-208ENST00000503062 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.39■■□□□ 1.17
ADD1-208ENST00000503062 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.34■■□□□ 1.17
ADD1-208ENST00000503062 ARHGEF11O15085 1522 aa22.3■■□□□ 1.16
ADD1-208ENST00000503062 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.28■■□□□ 1.16
ADD1-208ENST00000503062 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ADD1-208ENST00000503062 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ADD1-208ENST00000503062 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.19■■□□□ 1.14
ADD1-208ENST00000503062 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ADD1-208ENST00000503062 CFTRP13569 1480 aa22.06■■□□□ 1.12
ADD1-208ENST00000503062 WIZO95785 1651 aa22.05■■□□□ 1.12
ADD1-208ENST00000503062 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ADD1-208ENST00000503062 ARAP1Q96P48 1450 aa22.02■■□□□ 1.12
ADD1-208ENST00000503062 IFT140Q96RY7 1462 aa21.96■■□□□ 1.11
ADD1-208ENST00000503062 CHD1O14646 1710 aa21.88■■□□□ 1.09
ADD1-208ENST00000503062 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
ADD1-208ENST00000503062 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
ADD1-208ENST00000503062 PRDM2Q13029 1718 aa21.8■■□□□ 1.08
ADD1-208ENST00000503062 FBLN2P98095 1184 aa21.77■■□□□ 1.08
ADD1-208ENST00000503062 TOPBP1Q92547 1522 aa21.75■■□□□ 1.07
ADD1-208ENST00000503062 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.073e-9■■■□□ 15.5
ADD1-208ENST00000503062 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
ADD1-208ENST00000503062 ABCC8Q09428 1581 aa21.63■■□□□ 1.05
ADD1-208ENST00000503062 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ADD1-208ENST00000503062 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.6■■□□□ 1.05
ADD1-208ENST00000503062 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.59■■□□□ 1.05
ADD1-208ENST00000503062 SYNJ1O43426 1573 aa21.51■■□□□ 1.03
ADD1-208ENST00000503062 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ADD1-208ENST00000503062 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.47■■□□□ 1.03
ADD1-208ENST00000503062 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.45■■□□□ 1.03
ADD1-208ENST00000503062 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
ADD1-208ENST00000503062 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.44■■□□□ 1.02
ADD1-208ENST00000503062 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ADD1-208ENST00000503062 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.41■■□□□ 1.02
ADD1-208ENST00000503062 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
ADD1-208ENST00000503062 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
ADD1-208ENST00000503062 SOGA1O94964 1423 aa21.35■■□□□ 1.01
ADD1-208ENST00000503062 WDR97A6NE52 1622 aa21.33■■□□□ 1.01
ADD1-208ENST00000503062 SYNJ2O15056 1496 aa21.31■■□□□ 1
ADD1-208ENST00000503062 GRIN2BQ13224 1484 aa21.27■■□□□ 1
ADD1-208ENST00000503062 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.22■□□□□ 0.99
ADD1-208ENST00000503062 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.21■□□□□ 0.99
ADD1-208ENST00000503062 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.19■□□□□ 0.98
ADD1-208ENST00000503062 PBRM1Q86U86 1689 aa21.15■□□□□ 0.98
ADD1-208ENST00000503062 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.12■□□□□ 0.97
ADD1-208ENST00000503062 CEP170Q5SW79 1584 aa21.07■□□□□ 0.96
ADD1-208ENST00000503062 CUX1P39880 1505 aa21.05■□□□□ 0.96
ADD1-208ENST00000503062 GRIN2AQ12879 1464 aa21.01■□□□□ 0.95
ADD1-208ENST00000503062 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.99■□□□□ 0.95
ADD1-208ENST00000503062 KDM6BO15054 1643 aa20.97■□□□□ 0.95
ADD1-208ENST00000503062 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.97■□□□□ 0.95
ADD1-208ENST00000503062 SHROOM2Q13796 1616 aa20.96■□□□□ 0.95
ADD1-208ENST00000503062 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.96■□□□□ 0.95
ADD1-208ENST00000503062 NUP160Q12769 1436 aa20.95■□□□□ 0.95
ADD1-208ENST00000503062 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.91■□□□□ 0.94
ADD1-208ENST00000503062 DIP2BQ9P265 1576 aa20.9■□□□□ 0.94
ADD1-208ENST00000503062 ADAMTS12P58397 1594 aa20.89■□□□□ 0.94
ADD1-208ENST00000503062 MAPKBP1O60336 1514 aa20.86■□□□□ 0.93
ADD1-208ENST00000503062 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 193 ms