RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483558.5

PKD1-215, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-215	ENST00000483558	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		43.47	■■■■■ 4.55
PKD1-215	ENST00000483558	ABCC9	O60706	1549 aa		40.76	■■■■■ 4.12
PKD1-215	ENST00000483558	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.39	■■■■□ 3.9
PKD1-215	ENST00000483558	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		39.38	■■■■□ 3.89
PKD1-215	ENST00000483558	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		38.11	■■■■□ 3.69
PKD1-215	ENST00000483558	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	37.88	■■■■□ 3.65
PKD1-215	ENST00000483558	NACAD	O15069	1562 aa		37.54	■■■■□ 3.6
PKD1-215	ENST00000483558	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.52	■■■■□ 3.6
PKD1-215	ENST00000483558	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		37.38	■■■■□ 3.57
PKD1-215	ENST00000483558	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		37.12	■■■■□ 3.53
PKD1-215	ENST00000483558	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		36.86	■■■■□ 3.49
PKD1-215	ENST00000483558	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		36.76	■■■■□ 3.48
PKD1-215	ENST00000483558	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		36.69	■■■■□ 3.46
PKD1-215	ENST00000483558	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		36.51	■■■■□ 3.44
PKD1-215	ENST00000483558	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	36.27	■■■■□ 3.4
PKD1-215	ENST00000483558	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.22	■■■■□ 3.39
PKD1-215	ENST00000483558	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.02	■■■■□ 3.36
PKD1-215	ENST00000483558	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	35.72	■■■■□ 3.31
PKD1-215	ENST00000483558	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		35.67	■■■■□ 3.3
PKD1-215	ENST00000483558	CUX2	O14529	1486 aa		35.4	■■■■□ 3.26
PKD1-215	ENST00000483558	ERCC6	Q03468	1493 aa		35.21	■■■■□ 3.23
PKD1-215	ENST00000483558	TRIM41	Q8WV44	630 aa		34.93	■■■■□ 3.18
PKD1-215	ENST00000483558	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.71	■■■■□ 3.15
PKD1-215	ENST00000483558	NES	P48681	1621 aa		34.7	■■■■□ 3.15
PKD1-215	ENST00000483558	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.49	■■■■□ 3.11
PKD1-215	ENST00000483558	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	34.43	■■■■□ 3.1
PKD1-215	ENST00000483558	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.27	■■■■□ 3.08
PKD1-215	ENST00000483558	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.27	■■■■□ 3.08
PKD1-215	ENST00000483558	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		34.16	■■■■□ 3.06
PKD1-215	ENST00000483558	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.15	■■■■□ 3.06
PKD1-215	ENST00000483558	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.08	■■■■□ 3.05
PKD1-215	ENST00000483558	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		34.07	■■■■□ 3.05
PKD1-215	ENST00000483558	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.96	■■■■□ 3.03
PKD1-215	ENST00000483558	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	33.79	■■■■□ 3
PKD1-215	ENST00000483558	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		33.76	■■■□□ 2.99
PKD1-215	ENST00000483558	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PKD1-215	ENST00000483558	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PKD1-215	ENST00000483558	WDR62	O43379	1518 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PKD1-215	ENST00000483558	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.65	■■■□□ 2.98
PKD1-215	ENST00000483558	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PKD1-215	ENST00000483558	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PKD1-215	ENST00000483558	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PKD1-215	ENST00000483558	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PKD1-215	ENST00000483558	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PKD1-215	ENST00000483558	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PKD1-215	ENST00000483558	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
PKD1-215	ENST00000483558	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PKD1-215	ENST00000483558	ARHGEF11	O15085	1522 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PKD1-215	ENST00000483558	WIZ	O95785	1651 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PKD1-215	ENST00000483558	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
PKD1-215	ENST00000483558	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
PKD1-215	ENST00000483558	CFTR	P13569	1480 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PKD1-215	ENST00000483558	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
PKD1-215	ENST00000483558	ARAP1	Q96P48	1450 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PKD1-215	ENST00000483558	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PKD1-215	ENST00000483558	CHD1	O14646	1710 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PKD1-215	ENST00000483558	FBLN2	P98095	1184 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PKD1-215	ENST00000483558	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
PKD1-215	ENST00000483558	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PKD1-215	ENST00000483558	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.53	■■■□□ 2.8
PKD1-215	ENST00000483558	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PKD1-215	ENST00000483558	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
PKD1-215	ENST00000483558	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
PKD1-215	ENST00000483558	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
PKD1-215	ENST00000483558	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PKD1-215	ENST00000483558	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PKD1-215	ENST00000483558	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PKD1-215	ENST00000483558	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PKD1-215	ENST00000483558	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PKD1-215	ENST00000483558	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PKD1-215	ENST00000483558	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
PKD1-215	ENST00000483558	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
PKD1-215	ENST00000483558	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PKD1-215	ENST00000483558	SYNJ1	O43426	1573 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PKD1-215	ENST00000483558	SOGA1	O94964	1423 aa		32	■■■□□ 2.71
PKD1-215	ENST00000483558	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PKD1-215	ENST00000483558	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
PKD1-215	ENST00000483558	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PKD1-215	ENST00000483558	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PKD1-215	ENST00000483558	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PKD1-215	ENST00000483558	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PKD1-215	ENST00000483558	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PKD1-215	ENST00000483558	WDR97	A6NE52	1622 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PKD1-215	ENST00000483558	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PKD1-215	ENST00000483558	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PKD1-215	ENST00000483558	CUX1	P39880	1505 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PKD1-215	ENST00000483558	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		31.5	■■■□□ 2.63
PKD1-215	ENST00000483558	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PKD1-215	ENST00000483558	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PKD1-215	ENST00000483558	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PKD1-215	ENST00000483558	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PKD1-215	ENST00000483558	NUP160	Q12769	1436 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PKD1-215	ENST00000483558	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PKD1-215	ENST00000483558	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PKD1-215	ENST00000483558	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PKD1-215	ENST00000483558	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PKD1-215	ENST00000483558	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
PKD1-215	ENST00000483558	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	31.17	■■■□□ 2.58
PKD1-215	ENST00000483558	KDM6B	O15054	1643 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PKD1-215	ENST00000483558	TSPOAP1	O95153	1857 aa		31.15	■■■□□ 2.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms