RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP1-207ENST00000471650 ABCC9O60706 1549 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP1-207ENST00000471650 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP1-207ENST00000471650 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP1-207ENST00000471650 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1-207ENST00000471650 NACADO15069 1562 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1-207ENST00000471650 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1-207ENST00000471650 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1-207ENST00000471650 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1-207ENST00000471650 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-207ENST00000471650 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1-207ENST00000471650 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1-207ENST00000471650 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-207ENST00000471650 SCRIBQ14160 1630 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1-207ENST00000471650 CUX2O14529 1486 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1-207ENST00000471650 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1-207ENST00000471650 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1-207ENST00000471650 ERCC6Q03468 1493 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1-207ENST00000471650 TRIM41Q8WV44 630 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1-207ENST00000471650 NESP48681 1621 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1-207ENST00000471650 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-207ENST00000471650 NCAPD3P42695 1498 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP1-207ENST00000471650 SMARCA2P51531 1590 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1-207ENST00000471650 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1-207ENST00000471650 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1-207ENST00000471650 HMGXB3Q12766 1538 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1-207ENST00000471650 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
SH3BP1-207ENST00000471650 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP1-207ENST00000471650 SMARCA4P51532 1647 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-207ENST00000471650 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1-207ENST00000471650 WDR62O43379 1518 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-207ENST00000471650 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-207ENST00000471650 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-207ENST00000471650 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-207ENST00000471650 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-207ENST00000471650 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1-207ENST00000471650 OSCARQ8IYS5 282 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-207ENST00000471650 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-207ENST00000471650 ARHGEF11O15085 1522 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-207ENST00000471650 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-207ENST00000471650 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-207ENST00000471650 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP1-207ENST00000471650 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP1-207ENST00000471650 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1-207ENST00000471650 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-207ENST00000471650 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-207ENST00000471650 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-207ENST00000471650 ARAP1Q96P48 1450 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1-207ENST00000471650 WIZO95785 1651 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP1-207ENST00000471650 CFTRP13569 1480 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP1-207ENST00000471650 CHD1O14646 1710 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP1-207ENST00000471650 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1-207ENST00000471650 IFT140Q96RY7 1462 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-207ENST00000471650 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-207ENST00000471650 PRDM2Q13029 1718 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1-207ENST00000471650 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-207ENST00000471650 TOPBP1Q92547 1522 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-207ENST00000471650 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.73■□□□□ 0.756e-6■■■■□ 23.2
SH3BP1-207ENST00000471650 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-207ENST00000471650 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-207ENST00000471650 FBLN2P98095 1184 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-207ENST00000471650 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1-207ENST00000471650 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1-207ENST00000471650 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1-207ENST00000471650 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-207ENST00000471650 SYNJ1O43426 1573 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-207ENST00000471650 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-207ENST00000471650 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1-207ENST00000471650 ABCC8Q09428 1581 aa19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1-207ENST00000471650 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.44■□□□□ 0.7
SH3BP1-207ENST00000471650 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
SH3BP1-207ENST00000471650 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1-207ENST00000471650 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-207ENST00000471650 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1-207ENST00000471650 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-207ENST00000471650 SYNJ2O15056 1496 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1-207ENST00000471650 SOGA1O94964 1423 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1-207ENST00000471650 WDR97A6NE52 1622 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-207ENST00000471650 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1-207ENST00000471650 GRIN2BQ13224 1484 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-207ENST00000471650 PBRM1Q86U86 1689 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-207ENST00000471650 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-207ENST00000471650 CEP170Q5SW79 1584 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-207ENST00000471650 KDM6BO15054 1643 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-207ENST00000471650 SHROOM2Q13796 1616 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-207ENST00000471650 CUX1P39880 1505 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-207ENST00000471650 DIP2BQ9P265 1576 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1-207ENST00000471650 HECW2Q9P2P5 1572 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1-207ENST00000471650 ABCC10Q5T3U5 1492 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-207ENST00000471650 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-207ENST00000471650 GRIN2AQ12879 1464 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-207ENST00000471650 NUP160Q12769 1436 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1-207ENST00000471650 ADGRL1O94910 1474 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-207ENST00000471650 TSPOAP1O95153 1857 aa18.99■□□□□ 0.63
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